19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1952 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1621  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  453  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1952  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0891  hypothetical protein  45.83 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0392  hypothetical protein  48.37 
 
 		 183 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1725  hypothetical protein  46.91 
 
 		 188 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.952025  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0598  hypothetical protein  44.12 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.302437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1457  hypothetical protein  43.18 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.997202  normal  0.052641 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0408  hypothetical protein  42.05 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1202  hypothetical protein  38.71 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.696548  normal  0.814193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0528  hypothetical protein  42.69 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000041727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2264  hypothetical protein  44.91 
 
 		 385 aa  138  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0101423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0118  hypothetical protein  41.48 
 
 		 274 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.163485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1376  hypothetical protein  40.26 
 
 		 185 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.371971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2660  hypothetical protein  43.57 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1462  hypothetical protein  34.01 
 
 		 388 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2571  hypothetical protein  38.96 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137403  hitchhiker  0.000420654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1436  hypothetical protein  37.25 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0701  hypothetical protein  31.52 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0667  hypothetical protein  25.5 
 
 		 170 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>