19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1725 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1725  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  382  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.952025  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0891  hypothetical protein  52.91 
 
 
254 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1202  hypothetical protein  50.28 
 
 
273 aa  184  9e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.696548  normal  0.814193 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0118  hypothetical protein  51.4 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.163485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1457  hypothetical protein  50.28 
 
 
274 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.997202  normal  0.052641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0598  hypothetical protein  49.72 
 
 
237 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.302437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0408  hypothetical protein  49.16 
 
 
274 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0392  hypothetical protein  52.26 
 
 
183 aa  157  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1376  hypothetical protein  47.8 
 
 
185 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.371971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1952  hypothetical protein  46.91 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1621  hypothetical protein  46.91 
 
 
285 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2264  hypothetical protein  42.33 
 
 
385 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0101423  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0528  hypothetical protein  45.78 
 
 
200 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000041727  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2660  hypothetical protein  40.82 
 
 
190 aa  108  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1462  hypothetical protein  38 
 
 
388 aa  104  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2571  hypothetical protein  36.16 
 
 
222 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137403  hitchhiker  0.000420654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1436  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  91.3  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0701  hypothetical protein  32.02 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0667  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  45.1  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>