247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0505 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0335  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 65 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0449098  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0505  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 65 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0397339  hitchhiker  0.000000000219257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  55 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  67.5 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3289  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000215489  hitchhiker  0.00000182798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2942  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000229225  hitchhiker  0.00000342543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3636  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  decreased coverage  0.00000000000115697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2832  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000129889  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0322  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000137645  decreased coverage  0.00229804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0335  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000122941  normal  0.019257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0284  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204837  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2624  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.319258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0257  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00213265  normal  0.0167068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3768  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000105209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3455  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  decreased coverage  0.00364799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3060  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000156067  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2751  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000361638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0275  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000476905  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0356  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000200225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3161  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1932  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000362681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3738  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000269759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3796  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3486  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000914257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1272  50S ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  55.1 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3787  50S ribosomal protein L29  44.62 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0936197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  49.09 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  54.76 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  54.76 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0399  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0346  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.767822  decreased coverage  0.000256062 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  54.76 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2166  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4905  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0499084  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  49.09 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  64.1 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  64.1 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  64.1 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00738  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  64.1 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  64.1 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  64.1 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  63.16 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  47.27 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>