More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0273 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0273  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
256 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1720  parA family protein  97.66 
 
 
256 aa  487  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1411  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  97.27 
 
 
256 aa  484  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.190982  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.91 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 
295 aa  85.9  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.63 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  26.27 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  29.49 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  27.24 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  29.13 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.06 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.16 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  28.85 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  30.9 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  28.86 
 
 
268 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  26.29 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  27.69 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.06 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  28.29 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.32 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.35 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  31.32 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.51 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  30.98 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.57 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  27.35 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  26.64 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.13 
 
 
314 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  29.15 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.82 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
255 aa  79  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  27.03 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  26.05 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  27.27 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.24 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  27.03 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  26.22 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  33.74 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.02 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.42 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  29.79 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.92 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.98 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  28.11 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  28.28 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.48 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  26.12 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  29.89 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  24.6 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.97 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  28.35 
 
 
333 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.97 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  24.72 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  25.5 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  28.35 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.99 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.73 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  27.59 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  26.94 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  28.35 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.59 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.85 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.03 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.03 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.91 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>