62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3603 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3603  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  806    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.269205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1123  monogalactosyldiacylglycerol synthase  54.99 
 
 
388 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1204  monogalactosyldiacylglycerol synthase  55.52 
 
 
388 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.701548 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119506  Monogalactosyldiacylglycerol (MGDG) synthase  28.5 
 
 
501 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0550  monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.03 
 
 
399 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3178  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.38 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4379  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.79 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000132765  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1764  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  28.14 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4986  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  28.65 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2994  monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.66 
 
 
431 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000104311  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1913  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  24.71 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1794  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  24.63 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2159  glycosyltransferase 28 domain-containing protein  25.41 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3177  monogalactosyldiacylglycerol synthase  24.74 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3364  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.04 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.804764  hitchhiker  0.000516086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2020  monogalactosyldiacylglycerol synthase  29.45 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2414  monogalactosyldiacylglycerol synthase  23.94 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.798325  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9619  predicted protein  25.81 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14125  monogalactosyldiacylglycerol synthase  25.77 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0567  diacylglycerol glucosyltransferase  24.85 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0646  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.83 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0565  diacylglycerol glucosyltransferase  24.85 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0511  diacylglycerol glucosyltransferase  24.55 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0492  diacylglycerol glucosyltransferase  24.55 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0422  diacylglycerol glucosyltransferase  24.55 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.630174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0426  diacylglycerol glucosyltransferase  24.55 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.75702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0483  diacylglycerol glucosyltransferase  24.55 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1210  monogalactosyldiacylglycerol synthase  26.14 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0034  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  24.77 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0486  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  23.25 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0830  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.297317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0514  diacylglycerol glucosyltransferase  23.65 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4809  diacylglycerol glucosyltransferase  23.65 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.912854  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0428  diacylglycerol glucosyltransferase  23.95 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0606  diacylglycerol glucosyltransferase  26.56 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.274729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1966  monogalactosyldiacylglycerol synthase  24.29 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4013  hypothetical protein  25.76 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0692  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  19.89 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.971487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1910  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.06 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4132  monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.76 
 
 
396 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.950432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2476  monogalactosyldiacylglycerol synthase  25.95 
 
 
488 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460024  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2527  monogalactosyldiacylglycerol synthase  28.88 
 
 
482 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1184  monogalactosyldiacylglycerol synthase  25.65 
 
 
380 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540237  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1892  monogalactosyldiacylglycerol synthase  20.5 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0433  diacylglycerol glucosyltransferase  23.92 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2470  putative monogalactosyldiacylglycerol synthase  19.65 
 
 
374 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2180  putative monogalactosyldiacylglycerol synthase  19.25 
 
 
374 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351092  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5556  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase-like  26.84 
 
 
875 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0649  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  27.06 
 
 
618 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0710  putative monogalactosyldiacylglycerol synthase  25.28 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1034  diacylglycerol glucosyltransferase  24.46 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0784028  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1015  diacylglycerol glucosyltransferase  24.46 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00026709  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0693  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  20.27 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0629  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase-like protein  23.04 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.768955  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1083  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  25.86 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4177  glycosyltransferase family 28 protein  26.82 
 
 
886 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.359054  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0647  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase-like protein  23.55 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1550  UDP-N-acetylglucosamine:LPS N-acetylglucosamine transferase-like protein  26.17 
 
 
377 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.253554 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0202  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  23.74 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1551  hypothetical protein  30.15 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.169647  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0181  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  28.78 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0297091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2005  Undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptidebeta- N -acetylglucosaminyltransferase  33.64 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>