More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0196 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0196  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  100 
 
 
465 aa  970    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000404885  normal  0.202119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1307  glycoside hydrolase family protein  57.89 
 
 
458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0878  beta-glucosidase  56.02 
 
 
454 aa  530  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1210  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  54.2 
 
 
440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1584  glycoside hydrolase family 1  52.93 
 
 
451 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  40.83 
 
 
455 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  38.2 
 
 
470 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  38.25 
 
 
474 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  37.17 
 
 
461 aa  323  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3733  glycoside hydrolase family 1  37.34 
 
 
478 aa  316  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1103  6-phospho-beta-glucosidase  37.11 
 
 
478 aa  316  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  36.59 
 
 
479 aa  315  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl313  beta-glucosidase/alpha xylosidase  36.64 
 
 
469 aa  315  9.999999999999999e-85  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597092  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  38.14 
 
 
475 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  35.97 
 
 
479 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  36.65 
 
 
478 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  38.17 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  35.97 
 
 
478 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  35.98 
 
 
479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1821  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  36.59 
 
 
476 aa  307  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230632  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0469  6-phospho-beta-glucosidase  37.04 
 
 
478 aa  307  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4230  6-phospho-beta-glucosidase  35.04 
 
 
464 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  35.26 
 
 
465 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3189  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.98 
 
 
474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4246  glycoside hydrolase family 1  35.04 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  35.03 
 
 
464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3935  6-phospho-beta-glucosidase  35.04 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4273  glycoside hydrolase family protein  35.04 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  36.44 
 
 
478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2741  glycoside hydrolase family 1  35.39 
 
 
466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  34.05 
 
 
470 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03605  cryptic phospho-beta-glucosidase B  34.83 
 
 
464 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1668  glycoside hydrolase family 1  35.05 
 
 
465 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  36.38 
 
 
479 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2500  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 
478 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0968  glycoside hydrolase family 1  34.66 
 
 
480 aa  300  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0012  glycoside hydrolase family 1  35.61 
 
 
480 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0224  6-phospho-beta-glucosidase  35.58 
 
 
480 aa  299  6e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1705  glycoside hydrolase family 1  35.55 
 
 
465 aa  299  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  34.18 
 
 
475 aa  299  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  35.68 
 
 
477 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2140  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.66 
 
 
476 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1615  6-phospho-beta-glucosidase  35.55 
 
 
479 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  35.68 
 
 
477 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.71 
 
 
474 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  35.68 
 
 
477 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0575  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.14 
 
 
476 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603105  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2481  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.55 
 
 
476 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3208  6-phospho-beta-glucosidase BglA  35.68 
 
 
477 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.962709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  35.68 
 
 
477 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.276018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1637  6-phospho-beta-glucosidase  35.28 
 
 
479 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0011  glycoside hydrolase family 1  35.73 
 
 
480 aa  297  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.29 
 
 
474 aa  296  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.106134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0185  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  35.95 
 
 
496 aa  296  5e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000347604  hitchhiker  0.00387129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  35.88 
 
 
465 aa  296  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  36.32 
 
 
467 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1735  6-phospho-beta-glucosidase  35.55 
 
 
479 aa  296  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3001  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.29 
 
 
474 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0996  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.77 
 
 
474 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0301517 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0973  glycoside hydrolase family 1  35.77 
 
 
474 aa  294  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2852  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.77 
 
 
474 aa  294  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  33.62 
 
 
475 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2438  glycoside hydrolase family 1  35.41 
 
 
468 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0255622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2729  6-phospho-beta-glucosidase BglA  33.88 
 
 
478 aa  293  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.36988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02733  6-phospho-beta-glucosidase A  34.99 
 
 
479 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02696  hypothetical protein  34.99 
 
 
479 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1478  6-phospho-beta-glucosidase  33.88 
 
 
478 aa  292  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02566  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  35.37 
 
 
474 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2805  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 
478 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  34.99 
 
 
479 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02531  hypothetical protein  35.37 
 
 
474 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3060  6-phospho-beta-glucosidase BglA  34.99 
 
 
479 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  34.99 
 
 
479 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4075  glycoside hydrolase family 1  34.19 
 
 
467 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  34.85 
 
 
477 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 
477 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3228  6-phospho-beta-glucosidase BglA  34.78 
 
 
479 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0902  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  35.05 
 
 
486 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  34.99 
 
 
479 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3967  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  34.87 
 
 
474 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  34.29 
 
 
496 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0889  glycoside hydrolase family 1  34.66 
 
 
480 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3901  glycoside hydrolase family 1  33.61 
 
 
479 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00796853  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1348  glycoside hydrolase family 1  34.7 
 
 
487 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.843045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1544  beta-glucosidase  34.58 
 
 
478 aa  288  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2793  glycoside hydrolase family 1  34.39 
 
 
473 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0271062  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000818  6-phospho-beta-glucosidase  35.18 
 
 
463 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490689  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0767  glycoside hydrolase family 1  34.94 
 
 
475 aa  286  5.999999999999999e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0764  glycoside hydrolase family 1  33.68 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0771  glycoside hydrolase family 1  34.33 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.935854  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0341  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  35.54 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  34.33 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3320  glycoside hydrolase family protein  34.02 
 
 
477 aa  283  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974893  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0749  glycoside hydrolase family 1  34.25 
 
 
465 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3467  glycoside hydrolase family 1  34.45 
 
 
475 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  34.83 
 
 
466 aa  281  2e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
478 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  33.83 
 
 
478 aa  281  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0340  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  34.65 
 
 
481 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
478 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>