More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1348 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1048  glycoside hydrolase family 1  62.19 
 
 
483 aa  637    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1348  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 
487 aa  1019    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.843045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3965  glycoside hydrolase family protein  85.63 
 
 
487 aa  894    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1891  glycoside hydrolase family protein  59.83 
 
 
483 aa  598  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0764  glycoside hydrolase family 1  53.36 
 
 
489 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  53.4 
 
 
496 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  56.11 
 
 
462 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0902  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  54.04 
 
 
486 aa  528  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0771  glycoside hydrolase family 1  55.49 
 
 
462 aa  528  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.935854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  50.62 
 
 
479 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  53.29 
 
 
464 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  52.9 
 
 
465 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  51.76 
 
 
474 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.106134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  51.43 
 
 
479 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3001  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  51.35 
 
 
474 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0973  glycoside hydrolase family 1  50.93 
 
 
474 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2852  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  50.93 
 
 
474 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  49.79 
 
 
479 aa  502  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0996  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  50.93 
 
 
474 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0301517 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1103  6-phospho-beta-glucosidase  50.41 
 
 
478 aa  501  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3967  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  50.72 
 
 
474 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  50.93 
 
 
474 aa  501  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0749  glycoside hydrolase family 1  50.41 
 
 
465 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0889  glycoside hydrolase family 1  51.02 
 
 
480 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1821  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  51.03 
 
 
476 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
479 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0968  glycoside hydrolase family 1  50.52 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0575  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  49.9 
 
 
476 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603105  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  50.92 
 
 
475 aa  490  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3189  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  50.31 
 
 
474 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2481  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  50.41 
 
 
476 aa  488  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2438  glycoside hydrolase family 1  51.76 
 
 
468 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0255622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.19 
 
 
477 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.19 
 
 
477 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2741  glycoside hydrolase family 1  50.62 
 
 
466 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2140  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  50.41 
 
 
476 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.19 
 
 
477 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02566  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  49.38 
 
 
474 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4246  glycoside hydrolase family 1  52.06 
 
 
470 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  50.31 
 
 
471 aa  482  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1705  glycoside hydrolase family 1  52.38 
 
 
465 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2793  glycoside hydrolase family 1  51.84 
 
 
473 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0271062  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02531  hypothetical protein  49.38 
 
 
474 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4273  glycoside hydrolase family protein  52.06 
 
 
470 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3935  6-phospho-beta-glucosidase  52.06 
 
 
470 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3208  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.19 
 
 
477 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.962709  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000818  6-phospho-beta-glucosidase  50.93 
 
 
463 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03605  cryptic phospho-beta-glucosidase B  52.06 
 
 
464 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  48.79 
 
 
477 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.276018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4230  6-phospho-beta-glucosidase  52.06 
 
 
464 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1668  glycoside hydrolase family 1  50.31 
 
 
465 aa  478  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2500  glycoside hydrolase family protein  49.1 
 
 
478 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  47.98 
 
 
477 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  48.19 
 
 
479 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  48.39 
 
 
479 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06724  phospho-beta-glucosidase B  50.1 
 
 
463 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  47.98 
 
 
477 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  50.93 
 
 
465 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02733  6-phospho-beta-glucosidase A  47.78 
 
 
479 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3060  6-phospho-beta-glucosidase BglA  47.98 
 
 
479 aa  475  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3228  6-phospho-beta-glucosidase BglA  47.78 
 
 
479 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0767  glycoside hydrolase family 1  47.63 
 
 
475 aa  474  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3733  glycoside hydrolase family 1  48.57 
 
 
478 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  47.98 
 
 
479 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02696  hypothetical protein  47.78 
 
 
479 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  49.79 
 
 
467 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3320  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 
477 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974893  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  48.19 
 
 
478 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  48.66 
 
 
478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0224  6-phospho-beta-glucosidase  48.57 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0341  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  49.59 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0185  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  50.2 
 
 
496 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000347604  hitchhiker  0.00387129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0011  glycoside hydrolase family 1  47.87 
 
 
480 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0469  6-phospho-beta-glucosidase  48.07 
 
 
478 aa  465  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  47.86 
 
 
478 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0012  glycoside hydrolase family 1  47.76 
 
 
480 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1754  6-phospho-beta-glucosidase  47.48 
 
 
492 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000312177  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.68 
 
 
478 aa  459  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1735  6-phospho-beta-glucosidase  47.06 
 
 
479 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2729  6-phospho-beta-glucosidase BglA  47.26 
 
 
478 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.36988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1637  6-phospho-beta-glucosidase  47.15 
 
 
479 aa  458  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1615  6-phospho-beta-glucosidase  47.26 
 
 
479 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0340  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  46.96 
 
 
481 aa  457  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2805  glycoside hydrolase family protein  47.26 
 
 
478 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1478  6-phospho-beta-glucosidase  47.46 
 
 
478 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3901  glycoside hydrolase family 1  47.15 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00796853  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1668  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  47.28 
 
 
491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.396346  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2987  6-phospho-beta-glucosidase  48.78 
 
 
476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0783146 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl012  beta-glucosidase  45.57 
 
 
484 aa  443  1e-123  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl615  beta-glucosidase  46.12 
 
 
483 aa  442  1e-123  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1544  beta-glucosidase  47.34 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194171  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl034  6-phospho-beta-glucosidase  43.46 
 
 
483 aa  438  1e-121  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0190  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  45.33 
 
 
497 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136833 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  46.95 
 
 
478 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  46.95 
 
 
478 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  45.02 
 
 
455 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl430  6-phospho-beta-glucosidase  43.01 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl009  beta-glucosidase  42.09 
 
 
487 aa  397  1e-109  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  42.71 
 
 
470 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0942  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  39.79 
 
 
474 aa  371  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.933475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>