233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0460 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0460  Acyl carrier protein phosphodiesterase  100 
 
 
233 aa  470  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0269  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  47.95 
 
 
213 aa  198  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1299  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.89 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.448526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0871  acyl carrier protein phosphodiesterase 3; NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
213 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0908  hypothetical protein  38.79 
 
 
220 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0966  hypothetical protein  38.79 
 
 
220 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1070  hypothetical protein  39.07 
 
 
213 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  31.67 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  31.67 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  31.63 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  31.22 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  31.22 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  31.22 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  31.22 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  30.45 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  30.45 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  30 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  29.9 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  29.9 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  30.05 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  32.14 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.1 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  31 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.78 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3584  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.33 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000358393  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.08 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  30.05 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  30.34 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  30.34 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  30.34 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.99 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  30.34 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.21 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.56 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.56 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.26 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  28.09 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.67 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.61 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  28.09 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  28.09 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  28.09 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.09 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  28.09 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  28.09 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  28.8 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.11 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.71 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  28.71 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.81 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.81 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  29.83 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  28.96 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  28.96 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.09 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  28.96 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.96 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.33 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.65 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.78 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.11 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  30.3 
 
 
208 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  28.8 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.96 
 
 
201 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5175  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.59 
 
 
207 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  28.96 
 
 
201 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.49 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  27.96 
 
 
201 aa  62.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.76 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.25 
 
 
199 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.82 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  30.3 
 
 
208 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  35.04 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.09 
 
 
200 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  31.62 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4073  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.95 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  27.96 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.71 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  28.81 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.33 
 
 
198 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.33 
 
 
198 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  30.3 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  29.8 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  29.8 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  29.8 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.21 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  29.8 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  32.76 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.95 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  29.8 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.03 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.83 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>