16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22760  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  583  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.488821  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2129  secreted protein  52.44 
 
 
288 aa  235  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3533  hypothetical protein  49.4 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.77 
 
 
672 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4257  secreted protein  47.98 
 
 
311 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.256358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  39.76 
 
 
646 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4822  alkaline phosphatase  34.73 
 
 
261 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6675  hypothetical protein  34.55 
 
 
277 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  35.39 
 
 
608 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1372  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.22 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0780489  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  30.67 
 
 
607 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  28.74 
 
 
610 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02145  hypothetical protein  30.07 
 
 
493 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.935466 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06120  expressed protein  28.99 
 
 
455 aa  65.9  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0135237  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08808  hypothetical protein  26.94 
 
 
335 aa  65.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80898  predicted protein  23.51 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>