18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6675 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6675  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3533  hypothetical protein  38.31 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.84 
 
 		 672 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2129  secreted protein  38.49 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  39.58 
 
 		 646 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4257  secreted protein  35.34 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.256358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22760  hypothetical protein  34.55 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.488821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4822  alkaline phosphatase  30.5 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  28.52 
 
 		 607 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  28.83 
 
 		 608 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  29.75 
 
 		 610 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1372  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.41 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0780489  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02145  hypothetical protein  28.67 
 
 		 493 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.935466 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80898  predicted protein  24.01 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201382  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06120  expressed protein  25.09 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0135237  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08808  hypothetical protein  23.05 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2341  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  21.96 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0112  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46 
 
 		 260 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>