14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80898 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_80898  predicted protein  100 
 
 
348 aa  704    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201382  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02145  hypothetical protein  31.76 
 
 
493 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.935466 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08808  hypothetical protein  30.18 
 
 
335 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2129  secreted protein  26.21 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.35 
 
 
672 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6675  hypothetical protein  24.01 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06120  expressed protein  33.33 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0135237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3533  hypothetical protein  25.24 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  23.13 
 
 
646 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  23.39 
 
 
610 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22760  hypothetical protein  23.51 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.488821  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4257  secreted protein  22.73 
 
 
311 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.256358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  24.88 
 
 
607 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4822  alkaline phosphatase  22.33 
 
 
261 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>