16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2129 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2129  secreted protein  100 
 
 
288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3533  hypothetical protein  64.23 
 
 
323 aa  322  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.26 
 
 
672 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4257  secreted protein  55.47 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.256358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22760  hypothetical protein  52.44 
 
 
296 aa  235  7e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.488821  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  41 
 
 
646 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4822  alkaline phosphatase  36.59 
 
 
261 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6675  hypothetical protein  38.49 
 
 
277 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  33.1 
 
 
608 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  31.38 
 
 
610 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  28.98 
 
 
607 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1372  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.74 
 
 
252 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0780489  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02145  hypothetical protein  30.53 
 
 
493 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.935466 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08808  hypothetical protein  29.43 
 
 
335 aa  95.5  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06120  expressed protein  27.56 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0135237  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80898  predicted protein  26.21 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>