50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3544 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3544  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0218  Methyltransferase type 11  60.93 
 
 
204 aa  263  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1967  Methyltransferase type 11  52.56 
 
 
205 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247802  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1204  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 
243 aa  192  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.602867  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3116  methionine biosynthesis protein MetW  32.17 
 
 
202 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6451  methionine biosynthesis MetW  32.17 
 
 
202 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3038  methionine biosynthesis protein MetW  32.17 
 
 
202 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2486  methionine biosynthesis MetW  32.17 
 
 
202 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3100  methionine biosynthesis protein MetW  32.17 
 
 
202 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.698233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3155  methionine biosynthesis protein MetW  32.17 
 
 
202 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  28.45 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  26.45 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
238 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  28.46 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  29.81 
 
 
193 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
243 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
243 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  28.1 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
243 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0060  methionine biosynthesis protein MetW  28.7 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866888  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  26.61 
 
 
196 aa  45.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  26.77 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  25.6 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  25.6 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  26.77 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3732  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
274 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3097  methionine biosynthesis protein MetW  31.4 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588077  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0191  methionine biosynthesis protein MetW  26.56 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3442  methionine biosynthesis protein MetW  26.56 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3245  methionine biosynthesis protein MetW  26.56 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0376  methionine biosynthesis protein MetW  26.56 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0156  methionine biosynthesis protein MetW  26.56 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2906  methionine biosynthesis protein MetW  26.56 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2183  methionine biosynthesis protein MetW  26.56 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0181  methionine biosynthesis protein MetW  26.56 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  26.5 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  27.19 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0334  methionine biosynthesis protein MetW  28.07 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
319 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
249 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
209 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  28 
 
 
251 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
339 aa  42  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0187  methionine biosynthesis MetW  23.48 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  25 
 
 
205 aa  41.6  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4389  hypothetical protein  28.07 
 
 
202 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>