13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2135 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2135  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1153    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11758 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1198  hypothetical protein  41 
 
 
482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000167019  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0726  hypothetical protein  35.62 
 
 
513 aa  148  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.300811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2872  hypothetical protein  31.53 
 
 
700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.192718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2253  hypothetical protein  27.88 
 
 
495 aa  94  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0268  hypothetical protein  24.51 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.894315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0972  hypothetical protein  28.46 
 
 
269 aa  63.9  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3507  von Willebrand factor type A  21.97 
 
 
853 aa  61.6  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  23.42 
 
 
1181 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2136  hypothetical protein  27.13 
 
 
250 aa  50.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.484608  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0727  hypothetical protein  28 
 
 
249 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.266273  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2141  hypothetical protein  43.14 
 
 
1165 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.515545  normal  0.041224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3143  hypothetical protein  25.75 
 
 
255 aa  44.3  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>