20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1198 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1198  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  956    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000167019  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2135  hypothetical protein  41 
 
 		 580 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0726  hypothetical protein  32.95 
 
 		 513 aa  103  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.300811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2872  hypothetical protein  31.71 
 
 		 700 aa  93.6  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.192718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2253  hypothetical protein  30.32 
 
 		 495 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0268  hypothetical protein  29.3 
 
 		 497 aa  83.2  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.894315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  25.9 
 
 		 2267 aa  53.5  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1181 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  27.52 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1490  hypothetical protein  25.69 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0972  hypothetical protein  26.67 
 
 		 269 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  26.21 
 
 		 547 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  27.63 
 
 		 541 aa  47  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  25.81 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  27.21 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  27.21 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  25.52 
 
 		 547 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3507  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 		 853 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1168  hypothetical protein  32.65 
 
 		 535 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000338543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1138  hypothetical protein  44.68 
 
 		 538 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000071313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>