10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2253 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2253  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1009    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0268  hypothetical protein  56.29 
 
 
497 aa  544  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.894315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2135  hypothetical protein  27.88 
 
 
580 aa  97.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11758 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1198  hypothetical protein  30.32 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000167019  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2872  hypothetical protein  30.54 
 
 
700 aa  74.3  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.192718  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  27.12 
 
 
2267 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  25 
 
 
1181 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0972  hypothetical protein  27.02 
 
 
269 aa  54.3  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0727  hypothetical protein  23.61 
 
 
249 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.266273  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0726  hypothetical protein  22.38 
 
 
513 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.300811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>