16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0972 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0972  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  531  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2136  hypothetical protein  29.57 
 
 
250 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.484608  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0727  hypothetical protein  40.56 
 
 
249 aa  98.6  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.266273  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3143  hypothetical protein  29.94 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2861  hypothetical protein  27.73 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.820591  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0952  hypothetical protein  30.94 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1490  hypothetical protein  22.71 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2135  hypothetical protein  28.46 
 
 
580 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2871  hypothetical protein  30.43 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2377  hypothetical protein  27.7 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2253  hypothetical protein  27.02 
 
 
495 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2872  hypothetical protein  23.46 
 
 
700 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.192718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2142  hypothetical protein  23.08 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.196288  normal  0.0265272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1198  hypothetical protein  26.67 
 
 
482 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000167019  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0726  hypothetical protein  26.86 
 
 
513 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.300811  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  24.52 
 
 
1181 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>