13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0727 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0727  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.266273  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2136  hypothetical protein  40.24 
 
 
250 aa  175  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.484608  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0972  hypothetical protein  40.56 
 
 
269 aa  98.6  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2871  hypothetical protein  28.85 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170364  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3143  hypothetical protein  34.57 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0952  hypothetical protein  32.49 
 
 
268 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2142  hypothetical protein  27.33 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.196288  normal  0.0265272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2861  hypothetical protein  25.95 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.820591  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2135  hypothetical protein  28 
 
 
580 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1490  hypothetical protein  26.49 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1471  major facilitator transporter  28.26 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00021178 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0585  transposase, IS4  26.35 
 
 
369 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480865  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0870  transposase, IS4  26.35 
 
 
373 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>