55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3507 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3507  von Willebrand factor type A  100 
 
 
853 aa  1714    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
1188 aa  84  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2135  hypothetical protein  21.97 
 
 
580 aa  61.6  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  33.33 
 
 
335 aa  60.8  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  31.51 
 
 
1446 aa  58.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  30.36 
 
 
342 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.49 
 
 
3027 aa  55.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2872  hypothetical protein  32.54 
 
 
700 aa  54.3  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.192718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  26.32 
 
 
643 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  28.12 
 
 
341 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 
334 aa  52.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.33 
 
 
320 aa  52.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  27.08 
 
 
338 aa  51.2  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
329 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  26.56 
 
 
338 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  26.56 
 
 
339 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  27.08 
 
 
338 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  27.91 
 
 
334 aa  49.3  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 
330 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 
340 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 
373 aa  49.3  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 
330 aa  48.9  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  26.84 
 
 
334 aa  48.9  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.44 
 
 
338 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  27.91 
 
 
334 aa  48.9  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  25 
 
 
339 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  25.52 
 
 
339 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  25 
 
 
340 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 
316 aa  48.1  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 
336 aa  48.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 
418 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 
418 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 
415 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  27.78 
 
 
328 aa  47.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  29.28 
 
 
319 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  25.14 
 
 
339 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  25.99 
 
 
327 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  24.4 
 
 
324 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  24.31 
 
 
342 aa  47  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  26.46 
 
 
335 aa  46.6  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
892 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  26.74 
 
 
318 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
327 aa  45.8  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 
334 aa  45.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  22.99 
 
 
334 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  25.4 
 
 
339 aa  45.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  30.33 
 
 
419 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.77 
 
 
364 aa  45.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1198  hypothetical protein  26.92 
 
 
482 aa  45.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000167019  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  27.1 
 
 
330 aa  45.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 
363 aa  45.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
715 aa  44.3  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  26.75 
 
 
343 aa  44.3  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  29.27 
 
 
344 aa  44.3  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  26.92 
 
 
334 aa  44.3  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>