18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0027 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0048  tRNA-Leu  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0319872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0044  tRNA-Leu  95.52 
 
 		 85 bp  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  91.36 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0046  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0043  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0051  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859897  normal  0.191633 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0049  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0010  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0007  tRNA-Leu  87.65 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.375919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0045  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.459073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0018  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>