17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0043 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859897  normal  0.191633 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0010  tRNA-Leu  95.29 
 
 
88 bp  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0044  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0049  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0048  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  95.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0319872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  94.64 
 
 
85 bp  87.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  94.64 
 
 
85 bp  87.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  94.64 
 
 
85 bp  87.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0027  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  79.8  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0046  tRNA-Leu  89.55 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  91.07 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0007  tRNA-Leu  88.46 
 
 
84 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.375919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0045  tRNA-Leu  93.94 
 
 
84 bp  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.459073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0013  tRNA-Leu  91.18 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.348243  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0032  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0335468  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.343772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>