15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0007 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_R0007  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.375919  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0045  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  143  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.459073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0046  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0048  tRNA-Leu  90.12 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0319872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0027  tRNA-Leu  87.65 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0043  tRNA-Leu  88.46 
 
 
85 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0051  tRNA-Leu  88.46 
 
 
85 bp  56  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859897  normal  0.191633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0013  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.348243  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0010  tRNA-Leu  96.67 
 
 
85 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.010804  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0024  tRNA-Leu  83.53 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  89.74 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>