14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0049 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0044  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0043  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0051  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859897  normal  0.191633 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0048  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0319872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0027  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0046  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.343772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0032  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0335468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>