15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0045 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.459073 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0007  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  143  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.375919  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0046  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0048  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0319872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0027  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0013  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.348243  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0024  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0010  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.010804  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0043  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0051  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859897  normal  0.191633 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>