155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3073 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0081  transposase IS4 family protein  83.02 
 
 
424 aa  694    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.985684  normal  0.077965 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3073  transposase IS4 family protein  100 
 
 
424 aa  860    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3569  transposase IS4 family protein  89.86 
 
 
424 aa  763    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3567  transposase IS4 family protein  89.86 
 
 
424 aa  763    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0079  transposase  33.76 
 
 
435 aa  247  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2208  transposase  33.76 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000207559  normal  0.0676192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2591  transposase  33.76 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3489  transposase  33.5 
 
 
435 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.109099  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1397  transposase  32.48 
 
 
429 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.811071  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0719  transposase, IS4  26.22 
 
 
452 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  0.089906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0226  transposase, IS4  26.22 
 
 
452 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0912075  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1908  transposase, IS4  26.22 
 
 
452 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2821  transposase, IS4  27.01 
 
 
452 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0637  transposase IS4 family protein  24.58 
 
 
357 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0609  IS element transposase  21.93 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0115  IS4 family transposase  22.11 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0252  IS4 family transposase  22.11 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.583572  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0563  IS4 family transposase  22.11 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0870  transposase IS4 family protein  26.22 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100589  normal  0.585839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0509  transposase IS4 family protein  26.22 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0772109  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0552  transposase IS4 family protein  26.22 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2900  transposase IS4 family protein  27 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00460334  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0956  transposase for insertion sequence element D  20.38 
 
 
476 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2461  transposase A  20.22 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0060  transposase  20.22 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0108  transposase for insertion sequence element IS231  20.22 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0430  IS231 transposase  20.22 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0450  IS231 transposase  20.22 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0152  transposase for insertion sequence element D  21.47 
 
 
476 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1012  IS231-related transposase  21.87 
 
 
473 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0675  transposase IS4 family protein  22.08 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3339  IS231-related transposase  19.79 
 
 
476 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0410  IS231 transposase  20.49 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0043  IS231 transposase  21.88 
 
 
480 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0062  transposase  22.1 
 
 
511 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2577  transposase for insertion sequence element D  19.15 
 
 
476 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.166038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2573  transposase for insertion sequence element D  19.15 
 
 
476 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0899643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2049  transposase for insertion sequence element D  19.15 
 
 
476 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0980  transposase IS4 family protein  25.61 
 
 
294 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000144163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1032  transposase IS4 family protein  20.69 
 
 
476 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0359  IS231-related transposase  21.32 
 
 
476 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3330  IS231-related transposase  21.04 
 
 
477 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.179095  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0055  IS231-like, transposase  20.22 
 
 
484 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0010  hypothetical protein  20.83 
 
 
242 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3275  transposase IS4 family protein  30 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718214  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0024  transposase  20.71 
 
 
476 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0162  transposase IS4 family protein  30 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0213  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549208  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0559  transposase IS4 family protein  30.43 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2695  IS231-related transposase  20.27 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5556  IS231-related transposase  20.27 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322335  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0114  transposase for insertion sequence element IS231  21.51 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3618  transposase for insertion sequence element D  20.27 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000199851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3234  transposase for insertion sequence element D  20.27 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2965  transposase for insertion sequence element D  20.27 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0976  transposase for insertion sequence element D  20.27 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00116329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0119  transposase IS4 family protein  30.43 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373163  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0177  transposase for insertion sequence element D  20.27 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000644599  hitchhiker  3.2265700000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0862  transposase, IS4 family protein  24.88 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0019  ISPg4 transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.808263 
 
 
-
 
NC_002950  PG0050  ISPg4, transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0177  ISPg4, transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0225  ISPg4, transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0487  ISPg4, transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0970  ISPg4, transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.309605 
 
 
-
 
NC_002950  PG1261  ISPg4, transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1658  ISPg4, transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.198314 
 
 
-
 
NC_002950  PG1673  ISPg4, transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.185706 
 
 
-
 
NC_002950  PG2194  ISPg4, transposase  23.31 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0117  transposase for insertion sequence element D  20.38 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.621274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1952  transposase IS4 family protein  28.27 
 
 
414 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0252  ISGsu1, transposase  25.46 
 
 
372 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0299  ISGsu1, transposase  25.46 
 
 
372 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0957  ISGsu1, transposase  25.46 
 
 
372 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2141  ISGsu1, transposase, interruption  25.46 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2180  ISGsu1, transposase  25.46 
 
 
372 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3407  transposase IS4 family protein  28.27 
 
 
414 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111807  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0146  transposase for insertion sequence element D  20.38 
 
 
424 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1324  transposase IS4 family protein  22.38 
 
 
442 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2730  transposase IS4 family protein  22.38 
 
 
442 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000190979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4500  transposase IS4 family protein  22.38 
 
 
442 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128937  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5171  transposase IS4 family protein  22.38 
 
 
442 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0291  transposase, IS4 family protein  24.4 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2749  transposase, IS4 family protein  24.4 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2754  transposase, IS4 family protein  24.4 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1938  transposase IS4 family protein  20.92 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000606768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  24.76 
 
 
389 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2744  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000679967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3568  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2289  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000925206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1140  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000344199  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0028  IS186, transposase  27.69 
 
 
400 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2646  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
372 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0872  transposase, IS4 family protein  26.32 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0884  transposase, IS4 family protein  26.32 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1795  transposase, IS4 family protein  26.32 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3953  transposase IS4 family protein  25 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3686  transposase IS4 family protein  25 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4154  transposase IS4 family protein  25 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4418  transposase IS4 family protein  25 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000316762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>