19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0609 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0609  IS element transposase  100 
 
 		 268 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0637  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 357 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0010  hypothetical protein  35.29 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233756  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0226  transposase, IS4  26.62 
 
 		 452 aa  96.3  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0912075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1908  transposase, IS4  26.62 
 
 		 452 aa  96.3  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0719  transposase, IS4  26.62 
 
 		 452 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  0.089906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1397  transposase  27.59 
 
 		 429 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.811071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2208  transposase  27.19 
 
 		 435 aa  92  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000207559  normal  0.0676192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3489  transposase  27.19 
 
 		 435 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.109099  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2591  transposase  27.19 
 
 		 435 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2821  transposase, IS4  27.39 
 
 		 452 aa  89.7  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0079  transposase  27.35 
 
 		 435 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0081  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.985684  normal  0.077965 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3073  transposase IS4 family protein  21.93 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3567  transposase IS4 family protein  21.56 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3569  transposase IS4 family protein  21.56 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2707  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.44 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  26.88 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0993  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.94 
 
 		 362 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>