116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0162 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0559  transposase IS4 family protein  98.66 
 
 
372 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3275  transposase IS4 family protein  100 
 
 
372 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718214  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0119  transposase IS4 family protein  98.66 
 
 
372 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373163  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0162  transposase IS4 family protein  100 
 
 
372 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0213  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549208  normal  0.300119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00016  IS186 hypothetical protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00390  putative transposase insL for insertion sequence IS186  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00548  IS186 hypothetical protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0184605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01767  putative transposase insL for insertion sequence IS186  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02604  putative transposase insL for insertion sequence IS186  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1264  transposase IS4 family protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3046  transposase IS4 family protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.538378  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3581  transposase IS4 family protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0017  IS186, transposase  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.348239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0630  IS186, transposase  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2531  IS186, transposase  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0936  transposase IS4 family protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00116007  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1276  transposase IS4 family protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.242255  normal  0.047028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3063  transposase IS4 family protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00366415  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3640  transposase IS4 family protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00016  hypothetical protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00537  hypothetical protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0245305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02569  hypothetical protein  43.13 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01755  hypothetical protein  43.13 
 
 
372 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00394  hypothetical protein  43.13 
 
 
372 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0028  IS186, transposase  41.78 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0956  transposase for insertion sequence element D  24.93 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0115  IS4 family transposase  25.88 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0252  IS4 family transposase  25.88 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.583572  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0563  IS4 family transposase  25.88 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2049  transposase for insertion sequence element D  25.87 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2573  transposase for insertion sequence element D  25.87 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0899643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2577  transposase for insertion sequence element D  25.87 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.166038 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0146  transposase for insertion sequence element D  23.53 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105535 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0410  IS231 transposase  24.86 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0024  transposase  24.64 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0117  transposase for insertion sequence element D  23.53 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.621274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2051  transposase for insertion sequence element D  23.29 
 
 
476 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3339  IS231-related transposase  24.21 
 
 
476 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3330  IS231-related transposase  26.07 
 
 
477 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.179095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2461  transposase A  24.78 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0060  transposase  24.78 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0108  transposase for insertion sequence element IS231  24.78 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0430  IS231 transposase  24.78 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0450  IS231 transposase  24.78 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1938  transposase IS4 family protein  27.13 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000606768  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0152  transposase for insertion sequence element D  24.56 
 
 
476 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0062  transposase  22.71 
 
 
511 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0056  IS231-like, transposase  23.26 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5632  transposase IS4 family protein  21.82 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0359  IS231-related transposase  22.71 
 
 
476 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0043  IS231 transposase  23.08 
 
 
480 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0675  transposase IS4 family protein  23.22 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1032  transposase IS4 family protein  22.71 
 
 
476 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1324  transposase IS4 family protein  25.38 
 
 
442 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2730  transposase IS4 family protein  25.38 
 
 
442 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000190979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4500  transposase IS4 family protein  25.38 
 
 
442 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128937  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5171  transposase IS4 family protein  25.38 
 
 
442 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1012  IS231-related transposase  23.47 
 
 
473 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0074  IS231-related transposase  23.96 
 
 
460 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0055  IS231-like, transposase  22.46 
 
 
484 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2425  transposase  23.36 
 
 
489 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2695  IS231-related transposase  23.01 
 
 
476 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5556  IS231-related transposase  23.01 
 
 
476 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0761  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
270 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0177  transposase for insertion sequence element D  23.01 
 
 
476 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000644599  hitchhiker  3.2265700000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0976  transposase for insertion sequence element D  23.01 
 
 
476 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00116329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2965  transposase for insertion sequence element D  23.01 
 
 
476 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3234  transposase for insertion sequence element D  23.01 
 
 
476 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3618  transposase for insertion sequence element D  23.01 
 
 
476 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000199851  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0070  transposase  25 
 
 
278 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0114  transposase for insertion sequence element IS231  30.88 
 
 
460 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0637  transposase IS4 family protein  32.47 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4700  transposase IS4 family protein  37.84 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0081  transposase IS4 family protein  22.53 
 
 
424 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.985684  normal  0.077965 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1397  transposase  32.5 
 
 
429 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.811071  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0079  transposase  32.5 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2208  transposase  32.5 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000207559  normal  0.0676192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2591  transposase  32.5 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3489  transposase  32.5 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.109099  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3569  transposase IS4 family protein  32.35 
 
 
424 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3567  transposase IS4 family protein  32.35 
 
 
424 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1418  transposase IS4 family protein  25.24 
 
 
320 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000114596  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3073  transposase IS4 family protein  33.82 
 
 
424 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2821  transposase, IS4  35.71 
 
 
452 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  30.77 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  30.77 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  30.77 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  30.77 
 
 
442 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  30.77 
 
 
442 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  30.77 
 
 
448 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>