113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00390 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00016  IS186 hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00390  putative transposase insL for insertion sequence IS186  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00548  IS186 hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0184605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01767  putative transposase insL for insertion sequence IS186  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02604  putative transposase insL for insertion sequence IS186  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1264  transposase IS4 family protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3046  transposase IS4 family protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.538378  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3581  transposase IS4 family protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35932  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0028  IS186, transposase  92.97 
 
 
400 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0017  IS186, transposase  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.348239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0630  IS186, transposase  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2531  IS186, transposase  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0936  transposase IS4 family protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00116007  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1276  transposase IS4 family protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.242255  normal  0.047028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3063  transposase IS4 family protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00366415  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3640  transposase IS4 family protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00016  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00537  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0245305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00394  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  751    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02569  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01755  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  751    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495752  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3275  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
372 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718214  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0162  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
372 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0559  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
372 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0119  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
372 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373163  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0213  hypothetical protein  45.08 
 
 
179 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549208  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1324  transposase IS4 family protein  27.63 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2730  transposase IS4 family protein  27.63 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000190979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4500  transposase IS4 family protein  27.63 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128937  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5171  transposase IS4 family protein  27.63 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0056  IS231-like, transposase  22.3 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3330  IS231-related transposase  23.55 
 
 
477 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.179095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2049  transposase for insertion sequence element D  22.49 
 
 
476 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2573  transposase for insertion sequence element D  22.49 
 
 
476 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0899643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2577  transposase for insertion sequence element D  22.49 
 
 
476 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.166038 
 
 
-
 
NC_002978  WD0115  IS4 family transposase  22.77 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0252  IS4 family transposase  22.77 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.583572  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0563  IS4 family transposase  22.77 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3339  IS231-related transposase  22.99 
 
 
476 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2461  transposase A  23.53 
 
 
476 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0060  transposase  23.53 
 
 
476 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0108  transposase for insertion sequence element IS231  23.53 
 
 
476 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0430  IS231 transposase  23.53 
 
 
476 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0450  IS231 transposase  23.53 
 
 
476 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0146  transposase for insertion sequence element D  23.72 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105535 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0043  IS231 transposase  22.61 
 
 
480 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0062  transposase  22.22 
 
 
511 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0117  transposase for insertion sequence element D  23.72 
 
 
424 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.621274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0956  transposase for insertion sequence element D  22.16 
 
 
476 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1012  IS231-related transposase  21.73 
 
 
473 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0359  IS231-related transposase  22.93 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2051  transposase for insertion sequence element D  26.03 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0410  IS231 transposase  22.37 
 
 
478 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0024  transposase  27.21 
 
 
476 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5632  transposase IS4 family protein  20.29 
 
 
477 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0055  IS231-like, transposase  21.18 
 
 
484 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2695  IS231-related transposase  22.02 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5556  IS231-related transposase  22.02 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1032  transposase IS4 family protein  21.45 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0177  transposase for insertion sequence element D  22.02 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000644599  hitchhiker  3.2265700000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0976  transposase for insertion sequence element D  22.02 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00116329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2965  transposase for insertion sequence element D  22.02 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3234  transposase for insertion sequence element D  22.02 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3618  transposase for insertion sequence element D  22.02 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000199851  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0152  transposase for insertion sequence element D  21.05 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45320  Transposase, IS4  43.04 
 
 
437 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0119  transposase DDE domain-containing protein  23.9 
 
 
423 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32100  Transposase, IS4 protein  41.77 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0675  transposase IS4 family protein  25.13 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0637  transposase IS4 family protein  32.1 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3382  transposase IS4 family protein  39.56 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3846  transposase IS4 family protein  39.56 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0070  transposase  26 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4497  transposase IS4 family protein  39.56 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1397  transposase  31.25 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.811071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1938  transposase IS4 family protein  24.12 
 
 
440 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000606768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0079  transposase  30.21 
 
 
435 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2208  transposase  30.21 
 
 
435 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000207559  normal  0.0676192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2591  transposase  30.21 
 
 
435 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3489  transposase  30.21 
 
 
435 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.109099  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3462  transposase IS4 family protein  40.3 
 
 
465 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0261  transposase IS4  31.91 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3153  transposase IS4  31.91 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0912286  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3633  transposase IS4 family protein  37.36 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  36.84 
 
 
436 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2425  transposase  28.17 
 
 
489 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  34.07 
 
 
442 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  34.07 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  34.07 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3567  transposase IS4 family protein  30.56 
 
 
424 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>