117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1653 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1653  phosphate transporter  100 
 
 
388 aa  745    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.217957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0100  phosphate transporter  69.51 
 
 
394 aa  507  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1034  phosphate transporter  64.5 
 
 
402 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0659883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0102  phosphate transporter  65.37 
 
 
392 aa  481  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0857  phosphate transporter  60.64 
 
 
398 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0277  phosphate transporter  62.7 
 
 
392 aa  415  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2328  phosphate transporter  51.81 
 
 
391 aa  363  4e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1733  phosphate transporter  48.08 
 
 
393 aa  333  4e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3255  phosphate transporter  43.28 
 
 
414 aa  266  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.222052  decreased coverage  0.00950804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1958  phosphate transporter  32.78 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0757  phosphate transporter  26.02 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000549606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  25.08 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0884  phosphate transporter  26.25 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  22.8 
 
 
523 aa  71.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3389  phosphate transporter  30.35 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584823  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  25.19 
 
 
514 aa  69.7  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0286  phosphate transporter  24.92 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.612089  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  24.65 
 
 
505 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  24.65 
 
 
505 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3885  phosphate transporter  27.4 
 
 
347 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  23.56 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  26.02 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  24.74 
 
 
521 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  30.12 
 
 
461 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  24.72 
 
 
504 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0370  phosphate transporter  27.15 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205571  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0126  phosphate transporter  27.3 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0010  phosphate transporter  25.98 
 
 
309 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  22.82 
 
 
501 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0010  phosphate transporter  25.62 
 
 
309 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1549  phosphate transporter  28.11 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  30.17 
 
 
516 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  22.56 
 
 
502 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  23.92 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1999  phosphate transporter  25.38 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.529534  normal  0.207123 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  24.1 
 
 
496 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  23.12 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  27.11 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  23.59 
 
 
498 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  22.46 
 
 
422 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  27.27 
 
 
426 aa  56.2  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  23.12 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  28.29 
 
 
512 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4313  phosphate transporter  28.03 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  27.08 
 
 
333 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  20.81 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  21.17 
 
 
500 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  22.87 
 
 
429 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  26.1 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  22.87 
 
 
429 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  22.87 
 
 
429 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  22.87 
 
 
429 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  20.81 
 
 
417 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  22.4 
 
 
429 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  28.17 
 
 
418 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0789  phosphate transporter  22.19 
 
 
308 aa  53.1  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  23.22 
 
 
542 aa  53.1  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  21.66 
 
 
422 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  21.87 
 
 
429 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  21.87 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  27.74 
 
 
422 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0260  phosphate transporter  36.72 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.761515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  22.97 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  30.13 
 
 
429 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  27.83 
 
 
422 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  22.97 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0872  phosphate transporter  23.31 
 
 
312 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.152415  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1715  phosphate transporter  34.46 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  22.67 
 
 
424 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  29.01 
 
 
524 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  28.65 
 
 
514 aa  51.2  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3733  phosphate transporter  26.06 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  28.74 
 
 
508 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  28.74 
 
 
508 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1578  phosphate transporter  26.4 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  22.99 
 
 
422 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  25.17 
 
 
411 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  26.03 
 
 
333 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  26.79 
 
 
506 aa  49.7  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  26.09 
 
 
539 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  29.41 
 
 
549 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  22.28 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  22.05 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  22.45 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  24.85 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  28.97 
 
 
526 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  25.83 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  27.59 
 
 
508 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  21.33 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  25.7 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  23.08 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  25.74 
 
 
333 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  21.87 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  25.43 
 
 
535 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0331  phosphate transporter  35.88 
 
 
391 aa  47  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.799438  normal  0.0469398 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  26.29 
 
 
535 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  22.37 
 
 
494 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  23.82 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1967  phosphate transporter  24.24 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  27.34 
 
 
552 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>