264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0370 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0370  phosphate transporter  100 
 
 		 347 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205571  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3885  phosphate transporter  81.27 
 
 		 347 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0010  phosphate transporter  40.84 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0010  phosphate transporter  40.84 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0789  phosphate transporter  36.28 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0286  phosphate transporter  32.94 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.612089  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0884  phosphate transporter  32.92 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0726  phosphate transporter  28.83 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000419636  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0151  phosphate transporter  27.05 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  27.11 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0872  phosphate transporter  27.76 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.152415  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  24.63 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0037  phosphate transporter  23.08 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  29.64 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  36.65 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  24.44 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  25.23 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  25.3 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  25.3 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  28.3 
 
 		 512 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  31.25 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  32.26 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  31.11 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  31.25 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  31.06 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  30.25 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  31.25 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  25 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  31.52 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  34.44 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  33.33 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  31.79 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  25.89 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  29.3 
 
 		 522 aa  67  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  30.25 
 
 		 521 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  34.21 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  25.8 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  29.19 
 
 		 514 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  29.19 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  24.5 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  25.67 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  25.07 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  24.1 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  31.33 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  24.19 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2626  phosphate transporter  25.62 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_32  phosphate/sulfate transporter, PiT family  27.54 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  31.06 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0031  phosphate transporter  26.74 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.952576  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0034  phosphate transporter  27.49 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.81002  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  28.81 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  29.61 
 
 		 402 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1143  phosphate transporter  25.85 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.639626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  24.38 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  30.19 
 
 		 599 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  23.8 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  29.88 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  25.68 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  23.7 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  30.46 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1653  phosphate transporter  27.15 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.217957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  31.93 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  24.77 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  22.66 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0102  phosphate transporter  26.01 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  25.23 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  28.57 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  31.37 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  26.81 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  23.53 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  28.57 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  22.32 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  25.39 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4361  phosphate transporter  25.21 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  30.41 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  30.67 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  24.2 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  24.5 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  28.67 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  25.79 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  22.64 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1748  phosphate transporter  24.48 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0493657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  23.89 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  24.79 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  29.68 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  29.21 
 
 		 499 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  25.88 
 
 		 429 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  24.78 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  30.34 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  25.15 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  25.88 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1034  phosphate transporter  26.69 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0659883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  29.94 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1376  phosphate transporter  25.46 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000403006  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  25.88 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  28.66 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  25.88 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1508  phosphate transporter family protein  24.25 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0297003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  29.3 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  24.35 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>