More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3771 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  88.21 
 
 
429 aa  746    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  100 
 
 
424 aa  827    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  89.86 
 
 
429 aa  755    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  89.86 
 
 
429 aa  755    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  89.86 
 
 
429 aa  755    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  85.24 
 
 
422 aa  712    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  85.48 
 
 
422 aa  696    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  83.81 
 
 
422 aa  681    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  76.85 
 
 
422 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  89.86 
 
 
429 aa  755    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  91.04 
 
 
429 aa  761    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  90.8 
 
 
429 aa  758    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  85.48 
 
 
422 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  84.05 
 
 
422 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  83.81 
 
 
422 aa  706    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  90.8 
 
 
429 aa  759    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  83.77 
 
 
423 aa  685    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  73.01 
 
 
423 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  71.43 
 
 
421 aa  578  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  68.6 
 
 
431 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  65.87 
 
 
433 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  64.44 
 
 
419 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  64.76 
 
 
419 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  64.69 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  63.18 
 
 
423 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  63.96 
 
 
423 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  61.14 
 
 
420 aa  488  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  59.95 
 
 
422 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  57.76 
 
 
422 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  57.73 
 
 
417 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  59.85 
 
 
422 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  57.25 
 
 
417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  60.63 
 
 
423 aa  455  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  58.65 
 
 
418 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  56.27 
 
 
416 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  57.21 
 
 
418 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  48.73 
 
 
417 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  48.73 
 
 
417 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  44.9 
 
 
411 aa  349  6e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  41.54 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  42.96 
 
 
397 aa  297  3e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  42.86 
 
 
402 aa  293  4e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  42.09 
 
 
402 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  40.1 
 
 
411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  43.23 
 
 
426 aa  268  1e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  42.43 
 
 
523 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  41.75 
 
 
429 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  42.22 
 
 
411 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  40.94 
 
 
514 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  37.66 
 
 
461 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  37.44 
 
 
505 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  36.82 
 
 
505 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  40.43 
 
 
542 aa  235  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  39.04 
 
 
524 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  40.87 
 
 
549 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  37.8 
 
 
504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  40.74 
 
 
498 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  40.73 
 
 
526 aa  226  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  37.81 
 
 
499 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  41.49 
 
 
535 aa  222  9e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  34.4 
 
 
501 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  41.32 
 
 
499 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  39.17 
 
 
502 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  35 
 
 
494 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  37.6 
 
 
521 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  38.38 
 
 
520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  37.29 
 
 
500 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  38.3 
 
 
494 aa  206  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  35.79 
 
 
496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  47.29 
 
 
346 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  49.4 
 
 
497 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  39.13 
 
 
539 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  33.59 
 
 
512 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  48.24 
 
 
599 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  48.85 
 
 
535 aa  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  34.94 
 
 
474 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  48.28 
 
 
535 aa  149  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  35.22 
 
 
535 aa  149  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  45.9 
 
 
514 aa  149  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  43.2 
 
 
538 aa  146  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  36.82 
 
 
521 aa  145  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  48.54 
 
 
516 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  28.08 
 
 
391 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  34.23 
 
 
522 aa  144  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  40.09 
 
 
600 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  44.15 
 
 
506 aa  143  5e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  29.64 
 
 
399 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  42.19 
 
 
508 aa  137  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  42.19 
 
 
508 aa  137  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10343  phosphate-repressible Na+/phosphate cotransporter Pho89, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03010)  39.6 
 
 
580 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0889794  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  35.51 
 
 
552 aa  136  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  29.25 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  30.59 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  42.25 
 
 
508 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05450  sodium:inorganic phosphate symporter, putative  40.46 
 
 
596 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11011  conserved hypothetical protein  39.53 
 
 
558 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677966 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08956  phosphate-repressible phosphate permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01850)  41.95 
 
 
571 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66490  Na+/Pi symporter  37.8 
 
 
582 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.602489  normal  0.0911162 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0764  phosphate transporter  28.39 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.609739  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  27.62 
 
 
336 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>