More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0352 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  100 
 
 
423 aa  818    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  70.78 
 
 
422 aa  591  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  70.12 
 
 
422 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  65.4 
 
 
422 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  65.48 
 
 
423 aa  535  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  65.32 
 
 
423 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  64.58 
 
 
422 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  64.82 
 
 
422 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  64.32 
 
 
429 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  64.81 
 
 
422 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  64.32 
 
 
429 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  64.32 
 
 
429 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  64.32 
 
 
429 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  63.18 
 
 
424 aa  521  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  64.56 
 
 
429 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  63.18 
 
 
429 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  63.18 
 
 
429 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  62.95 
 
 
429 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  61.37 
 
 
419 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  63.19 
 
 
431 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  61.32 
 
 
433 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  66.26 
 
 
422 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  65 
 
 
422 aa  521  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  60.71 
 
 
428 aa  518  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  64.15 
 
 
423 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  60.43 
 
 
419 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  63.86 
 
 
422 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  57.92 
 
 
422 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  63.03 
 
 
421 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  59.47 
 
 
417 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  59.23 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  64.49 
 
 
423 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  60.95 
 
 
418 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  57.25 
 
 
420 aa  441  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  59.9 
 
 
418 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  57.66 
 
 
416 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  46.89 
 
 
417 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  46.89 
 
 
417 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  49.03 
 
 
411 aa  376  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  42.99 
 
 
411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  43.61 
 
 
397 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  42.44 
 
 
401 aa  295  7e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  40.05 
 
 
402 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  40.9 
 
 
402 aa  278  9e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  40.68 
 
 
411 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  42.63 
 
 
523 aa  262  8.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  39.07 
 
 
461 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  40.1 
 
 
429 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  43.28 
 
 
514 aa  259  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  40.93 
 
 
426 aa  256  5e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  43.62 
 
 
498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  40.48 
 
 
505 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  40.71 
 
 
505 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  41.9 
 
 
524 aa  247  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  39.57 
 
 
504 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  44.92 
 
 
535 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  42.16 
 
 
549 aa  236  6e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  40 
 
 
520 aa  235  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  42.59 
 
 
542 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  44.3 
 
 
526 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  34.86 
 
 
501 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  40.48 
 
 
521 aa  226  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  38.46 
 
 
500 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  38.24 
 
 
499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  40.97 
 
 
502 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  35.54 
 
 
494 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  37.3 
 
 
499 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  40.91 
 
 
494 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  34.82 
 
 
496 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  54.1 
 
 
346 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  36.33 
 
 
512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  38.17 
 
 
535 aa  160  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  45.25 
 
 
506 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  38.06 
 
 
514 aa  158  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  46.2 
 
 
535 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  45.65 
 
 
535 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  30.42 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  49.13 
 
 
599 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  41.91 
 
 
522 aa  154  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  44.13 
 
 
516 aa  153  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  44.94 
 
 
508 aa  153  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  44.94 
 
 
508 aa  153  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  29.3 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  39.67 
 
 
539 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  44.63 
 
 
508 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  31.6 
 
 
394 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  36.84 
 
 
552 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  33.33 
 
 
474 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  43.53 
 
 
497 aa  144  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  30.73 
 
 
338 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  37.5 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  47.34 
 
 
600 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05450  sodium:inorganic phosphate symporter, putative  41.99 
 
 
596 aa  137  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  47.34 
 
 
538 aa  136  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10343  phosphate-repressible Na+/phosphate cotransporter Pho89, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03010)  43.18 
 
 
580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0889794  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  28.96 
 
 
391 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.335253 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11011  conserved hypothetical protein  41.52 
 
 
558 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  26.73 
 
 
336 aa  126  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08956  phosphate-repressible phosphate permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01850)  40 
 
 
571 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  27.71 
 
 
336 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>