More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_32 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_32  phosphate/sulfate transporter, PiT family  100 
 
 
333 aa  641    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0034  phosphate transporter  97.3 
 
 
333 aa  629  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.81002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0031  phosphate transporter  96.1 
 
 
333 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.952576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  49.68 
 
 
338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2668  phosphate transporter  50.94 
 
 
331 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0197225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  47.48 
 
 
337 aa  275  9e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  45.99 
 
 
333 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  47.3 
 
 
336 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  44.55 
 
 
333 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  45.37 
 
 
333 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  44.75 
 
 
333 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  45.83 
 
 
332 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  45.09 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  44.24 
 
 
333 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  43.24 
 
 
332 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  43.43 
 
 
329 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  48.54 
 
 
334 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1748  phosphate transporter  45.87 
 
 
332 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0493657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  45.9 
 
 
346 aa  256  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  44.17 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  45.87 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  43.22 
 
 
332 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  46.2 
 
 
385 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  45.71 
 
 
333 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  45.6 
 
 
336 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  43.14 
 
 
336 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  43.14 
 
 
336 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  49.18 
 
 
330 aa  242  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  43.85 
 
 
336 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  44.51 
 
 
354 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  45.06 
 
 
337 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  42.16 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  46.1 
 
 
336 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  44 
 
 
336 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  44 
 
 
336 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  44.55 
 
 
336 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  41.83 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  41.83 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  39.94 
 
 
332 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  42.9 
 
 
336 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  42.47 
 
 
336 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  42.47 
 
 
336 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  42.47 
 
 
336 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  40.18 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  45 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  42.3 
 
 
336 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  42.47 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1443  phosphate transporter  40.55 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315159  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  46.77 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  42.47 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  42.02 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  46.38 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  42.14 
 
 
336 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  45.66 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  45.05 
 
 
334 aa  232  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  42.02 
 
 
332 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  42.21 
 
 
336 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  41.41 
 
 
332 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  38.74 
 
 
332 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  41.69 
 
 
336 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3000  phosphate transporter  40.42 
 
 
350 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  41.48 
 
 
332 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  43.51 
 
 
336 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  42.72 
 
 
336 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  41.28 
 
 
331 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  42.81 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  42.81 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  42.81 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  42.81 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  42.81 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  42.81 
 
 
336 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  41.14 
 
 
336 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  42.81 
 
 
354 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  42.81 
 
 
354 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  41.67 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  46.56 
 
 
332 aa  225  8e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  43.14 
 
 
336 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1792  phosphate transporter  43.33 
 
 
336 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  42.48 
 
 
335 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  41.8 
 
 
336 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  42.12 
 
 
336 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  43.67 
 
 
343 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2626  phosphate transporter  43.17 
 
 
327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  41.57 
 
 
334 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2817  phosphate transporter  43.75 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  43.28 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  40.12 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  41.67 
 
 
334 aa  220  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00181  transport protein  39.45 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0559  phosphate transporter  39.62 
 
 
313 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1376  phosphate transporter  38.14 
 
 
332 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000403006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1178  phosphate transporter  39.64 
 
 
332 aa  219  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1576  phosphate transporter family protein  38.14 
 
 
332 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000371851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1614  phosphate transporter family protein  38.14 
 
 
332 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000923139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1361  phosphate transporter family protein  38.14 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000679914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1335  phosphate transporter  38.14 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000375914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1334  phosphate transporter  38.14 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000421375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1545  phosphate transporter family protein  38.14 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000352137 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1471  phosphate transporter family protein  38.14 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.466845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1508  phosphate transporter family protein  38.44 
 
 
332 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0297003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>