More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0543 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  65.06 
 
 		 542 aa  665    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  64.27 
 
 		 524 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  64.58 
 
 		 526 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  100 
 
 		 523 aa  1039    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  59.32 
 
 		 514 aa  578  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  60.39 
 
 		 521 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  56.42 
 
 		 535 aa  537  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  54.88 
 
 		 549 aa  510  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  51.26 
 
 		 504 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  50.87 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  50.87 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  46.91 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  50.19 
 
 		 494 aa  422  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  45.93 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  48.25 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  50.33 
 
 		 520 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  44.05 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  45.06 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  45.74 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  54.8 
 
 		 494 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  40.66 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  44.47 
 
 		 422 aa  276  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  42.43 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  41.53 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  42.7 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  42.7 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  42.7 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  42.7 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  43.4 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  42.43 
 
 		 424 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  41.44 
 
 		 422 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  43.36 
 
 		 422 aa  263  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  42.63 
 
 		 423 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  43.4 
 
 		 422 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  40.64 
 
 		 423 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  41.62 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  40.85 
 
 		 419 aa  259  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  41.35 
 
 		 429 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  43.13 
 
 		 422 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  41.67 
 
 		 428 aa  258  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  41.62 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  42.59 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  40.43 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  42.4 
 
 		 417 aa  253  7e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  39.5 
 
 		 401 aa  253  7e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  39.52 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  43.16 
 
 		 422 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  42.13 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  40.66 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  39.36 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  41.62 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  39.68 
 
 		 411 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  42.3 
 
 		 431 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  39.58 
 
 		 422 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  38.61 
 
 		 411 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  41.1 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  42.4 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  38.17 
 
 		 420 aa  233  5e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  41.62 
 
 		 418 aa  233  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  38.29 
 
 		 402 aa  227  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  37.71 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  40.68 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  34.57 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  38.08 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  39.78 
 
 		 426 aa  212  2e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  34.57 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  40.53 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  39.74 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  34.78 
 
 		 429 aa  190  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  32.19 
 
 		 461 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  35.59 
 
 		 346 aa  169  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  46.7 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  48.19 
 
 		 599 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  48.19 
 
 		 512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  48.21 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  40.65 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  44 
 
 		 506 aa  143  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  45.66 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  45.66 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  44.39 
 
 		 539 aa  140  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  45.83 
 
 		 552 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  40.3 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  40.3 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  29.78 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  28.69 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  41.67 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  40.8 
 
 		 508 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  30.48 
 
 		 336 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  41.12 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  28.69 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  40.22 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  31.35 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  31.75 
 
 		 538 aa  109  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  28.61 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  28.57 
 
 		 334 aa  107  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  30.2 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  29.43 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66490  Na+/Pi symporter  39.61 
 
 		 582 aa  103  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.602489  normal  0.0911162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  27.13 
 
 		 335 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  26.7 
 
 		 332 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>