More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0542 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  65.06 
 
 		 523 aa  681    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  100 
 
 		 542 aa  1065    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  65.13 
 
 		 526 aa  629  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  63.2 
 
 		 524 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  58.52 
 
 		 514 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  59.65 
 
 		 521 aa  537  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  53.56 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  51.79 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  50.92 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  52.22 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  52.42 
 
 		 505 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  49.1 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  49.13 
 
 		 494 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  45.88 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  50.11 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  47.48 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  45.95 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  44.4 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  57.29 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  45.22 
 
 		 499 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  45.86 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  42.52 
 
 		 423 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  42.06 
 
 		 422 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  40.43 
 
 		 424 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  42.59 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  40.11 
 
 		 397 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  40.43 
 
 		 429 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  40.05 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  40.05 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  40.05 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  40.05 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  38.68 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  40.05 
 
 		 422 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  39.41 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  41.42 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  40.54 
 
 		 419 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  39.52 
 
 		 429 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  39.79 
 
 		 422 aa  238  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  39.14 
 
 		 417 aa  237  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  39.52 
 
 		 429 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  39.29 
 
 		 411 aa  236  9e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  40 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  38.23 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  39.52 
 
 		 429 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  41.8 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  40 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  40.43 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  41.18 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  39.53 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  39.95 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  39.79 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  43.32 
 
 		 423 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  35.86 
 
 		 420 aa  223  9e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  38.68 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  39.04 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  36.5 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  38.07 
 
 		 431 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  39.78 
 
 		 426 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  36.72 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  35.61 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  40.53 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  40.74 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  39.52 
 
 		 421 aa  206  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  40.68 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  33.87 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  33.87 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  37.53 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  34.67 
 
 		 429 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  40.05 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  31.83 
 
 		 461 aa  170  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  34.72 
 
 		 346 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  43.78 
 
 		 599 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  39.34 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  41.35 
 
 		 516 aa  137  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  45.98 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  44.51 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  45.4 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  44.51 
 
 		 514 aa  134  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  46.24 
 
 		 508 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  29.3 
 
 		 391 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  45.34 
 
 		 512 aa  133  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  46.24 
 
 		 508 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  41.63 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  48.28 
 
 		 552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  39.27 
 
 		 522 aa  128  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  44.51 
 
 		 508 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  43.75 
 
 		 521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  28.17 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  41.46 
 
 		 497 aa  117  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66490  Na+/Pi symporter  37.7 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.602489  normal  0.0911162 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  27.22 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.335253 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08956  phosphate-repressible phosphate permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01850)  37.59 
 
 		 571 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  43.8 
 
 		 600 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  43.8 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11011  conserved hypothetical protein  38.69 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.677966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  27.67 
 
 		 335 aa  97.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  28.41 
 
 		 332 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  28.57 
 
 		 336 aa  94  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  28.57 
 
 		 336 aa  94  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  29.33 
 
 		 394 aa  93.6  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>