More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0900 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  100 
 
 
502 aa  974    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  57.17 
 
 
498 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  50.2 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  54.1 
 
 
505 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  53.66 
 
 
504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  53.89 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  48.64 
 
 
523 aa  448  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  52.65 
 
 
520 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  52.18 
 
 
524 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  47.71 
 
 
526 aa  425  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  48.73 
 
 
500 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  48.45 
 
 
542 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  49.4 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  54.79 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  46.48 
 
 
501 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  48.2 
 
 
499 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  50.6 
 
 
521 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  48.8 
 
 
499 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  46.67 
 
 
549 aa  380  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  46.46 
 
 
535 aa  352  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  44.22 
 
 
496 aa  336  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  36.67 
 
 
422 aa  243  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  38.34 
 
 
397 aa  243  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  36.32 
 
 
401 aa  239  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  41.56 
 
 
423 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  40.55 
 
 
428 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  39.16 
 
 
419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  38.62 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  38.62 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  40.78 
 
 
423 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  39.84 
 
 
429 aa  231  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  38.74 
 
 
422 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  41.44 
 
 
474 aa  229  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  38.12 
 
 
419 aa  229  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  39.17 
 
 
429 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  39.17 
 
 
429 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  39.17 
 
 
429 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  39.17 
 
 
429 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  40.97 
 
 
423 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  39.17 
 
 
424 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  39.23 
 
 
422 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  39.89 
 
 
429 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  39.12 
 
 
411 aa  224  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  39.89 
 
 
429 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  36.67 
 
 
433 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  38.95 
 
 
422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  40.17 
 
 
429 aa  222  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  39.84 
 
 
411 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  36.29 
 
 
420 aa  221  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  40.97 
 
 
422 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  39.89 
 
 
422 aa  219  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  39.13 
 
 
431 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  41.71 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  40.28 
 
 
422 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  39.34 
 
 
422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  42.01 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  39.08 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  38.78 
 
 
423 aa  212  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  41.37 
 
 
418 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  37.01 
 
 
402 aa  209  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  32.89 
 
 
402 aa  208  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  38.18 
 
 
421 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  32.42 
 
 
429 aa  190  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  41.48 
 
 
416 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  38.99 
 
 
411 aa  186  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  37 
 
 
346 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  38.99 
 
 
418 aa  182  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  31.77 
 
 
417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  37.93 
 
 
426 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  31.77 
 
 
417 aa  180  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  45.71 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  39.9 
 
 
516 aa  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  43.62 
 
 
514 aa  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  39.2 
 
 
506 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  39.2 
 
 
508 aa  133  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  39.2 
 
 
508 aa  133  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  45.4 
 
 
599 aa  133  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  32.53 
 
 
399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  40.22 
 
 
508 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  41.46 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  27.88 
 
 
391 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  38.31 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  35 
 
 
461 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  43.17 
 
 
535 aa  120  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  31.8 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  43.17 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  38.57 
 
 
552 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  42.2 
 
 
539 aa  114  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  26.52 
 
 
391 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  29.71 
 
 
335 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  29.71 
 
 
335 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  38.74 
 
 
521 aa  104  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05450  sodium:inorganic phosphate symporter, putative  34.42 
 
 
596 aa  103  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  28.34 
 
 
394 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0031  phosphate transporter  29.33 
 
 
333 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.952576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_32  phosphate/sulfate transporter, PiT family  29.61 
 
 
333 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11011  conserved hypothetical protein  40.15 
 
 
558 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677966 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  42.28 
 
 
600 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  42.28 
 
 
538 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66490  Na+/Pi symporter  33.72 
 
 
582 aa  99  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.602489  normal  0.0911162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>