19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1920 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1920  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  368  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2781  hypothetical protein  29.21 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.84531  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0738  hypothetical protein  27.84 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.245856  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1192  hypothetical protein  27.43 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0563  hypothetical protein  25.71 
 
 
290 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190539  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2717  hypothetical protein  42.86 
 
 
265 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.988672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1576  hypothetical protein  42.86 
 
 
265 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2632  hypothetical protein  42.86 
 
 
265 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
269 aa  44.7  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
267 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  51.85 
 
 
265 aa  42  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
252 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
341 aa  41.6  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  43.33 
 
 
294 aa  41.6  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.94 
 
 
345 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
261 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>