15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0563 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0563  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  598  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190539  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0562  putative methyltransferase  31.77 
 
 
272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.272656  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3559  hypothetical protein  28.68 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.648065  normal  0.465267 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2781  hypothetical protein  31.53 
 
 
180 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.84531  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5555  hypothetical protein  26.72 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63940  hypothetical protein  26.29 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0738  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.245856  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1192  hypothetical protein  31.73 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3919  hypothetical protein  24.79 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2632  hypothetical protein  31.82 
 
 
265 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000104033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1576  hypothetical protein  31.82 
 
 
265 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2717  hypothetical protein  31.82 
 
 
265 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.988672  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2496  hypothetical protein  27.73 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000716186  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2545  hypothetical protein  27.73 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00421343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
724 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>