13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3919 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3919  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  524  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2496  hypothetical protein  39 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000716186  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2545  hypothetical protein  39 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00421343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2374  hypothetical protein  41 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0894499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63940  hypothetical protein  31.33 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5555  hypothetical protein  30.9 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1576  hypothetical protein  27.54 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2632  hypothetical protein  27.12 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000104033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2717  hypothetical protein  27.12 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.988672  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1192  hypothetical protein  38.33 
 
 		 177 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0563  hypothetical protein  24.79 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0738  hypothetical protein  28.77 
 
 		 185 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.245856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2781  hypothetical protein  33.8 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.84531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>