42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0800 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0800  small basic protein  100 
 
 		 110 aa  209  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0475  hypothetical protein  85.32 
 
 		 110 aa  158  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0581165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2104  protein of unknown function DUF1290  60.91 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15000  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  59.09 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0759178  normal  0.760857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18240  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  59.09 
 
 		 110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.596728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1888  protein of unknown function DUF1290  60 
 
 		 110 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.17032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3099  protein of unknown function DUF1290  57.27 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1304  protein of unknown function DUF1290  60 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.959278  normal  0.758297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4013  protein of unknown function DUF1290  58.18 
 
 		 110 aa  126  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0673159  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1229  hypothetical protein  55.77 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1736  protein of unknown function DUF1290  62.77 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.530931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2523  hypothetical protein  62.37 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2385  hypothetical protein  61.29 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15500  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  63.44 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2716  hypothetical protein  61.82 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11854  hypothetical protein  61.11 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3125  protein of unknown function DUF1290  61.82 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3405  hypothetical protein  58.33 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.349245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2878  hypothetical protein  56.48 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2891  hypothetical protein  56.48 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2847  hypothetical protein  56.48 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2729  protein of unknown function DUF1290  64.52 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3138  hypothetical protein  63.74 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360881  normal  0.0390517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1465  hypothetical protein  51.38 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0848  hypothetical protein  41.35 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00236162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5000  hypothetical protein  57.14 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1286  protein of unknown function DUF1290  40.95 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.852068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0682  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1062  protein of unknown function DUF1290  38.32 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1824  small basic protein  44 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0213812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2110  small basic protein  44 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.226594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1556  protein of unknown function DUF1290  43.14 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0831  hypothetical protein  43.33 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00113741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4058  protein of unknown function DUF1290  39.42 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1896  protein of unknown function DUF1290  39.36 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1026  protein of unknown function DUF1290  37.25 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3504  hypothetical protein  36.27 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1429  hypothetical protein  39.08 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00327831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2066  protein of unknown function DUF1290  33.64 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00878211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0782  hypothetical protein  34.65 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000814853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2005  hypothetical protein  37.23 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0328457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0469833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>