42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2729 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2729  protein of unknown function DUF1290  100 
 
 		 110 aa  205  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18240  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  77.27 
 
 		 110 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.596728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4013  protein of unknown function DUF1290  77.27 
 
 		 110 aa  167  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0673159  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1304  protein of unknown function DUF1290  75.45 
 
 		 110 aa  166  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.959278  normal  0.758297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2104  protein of unknown function DUF1290  78.18 
 
 		 110 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1888  protein of unknown function DUF1290  73.64 
 
 		 110 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.17032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3099  protein of unknown function DUF1290  75.45 
 
 		 110 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15000  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  72.73 
 
 		 110 aa  158  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0759178  normal  0.760857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1229  hypothetical protein  72.73 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1736  protein of unknown function DUF1290  82.8 
 
 		 110 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.530931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2523  hypothetical protein  80.65 
 
 		 110 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2385  hypothetical protein  80.65 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3125  protein of unknown function DUF1290  75.45 
 
 		 110 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3405  hypothetical protein  72.73 
 
 		 110 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.349245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2847  hypothetical protein  72.73 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2878  hypothetical protein  72.73 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2891  hypothetical protein  72.73 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2716  hypothetical protein  73.64 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15500  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  72.04 
 
 		 110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11854  hypothetical protein  72.73 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3138  hypothetical protein  75.53 
 
 		 117 aa  120  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360881  normal  0.0390517 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0800  small basic protein  60.91 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0475  hypothetical protein  59.63 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0581165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1465  hypothetical protein  55.96 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1286  protein of unknown function DUF1290  52.34 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.852068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0848  hypothetical protein  45.37 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00236162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1556  protein of unknown function DUF1290  53.4 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5000  hypothetical protein  60.44 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2110  small basic protein  48.57 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.226594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1824  small basic protein  48.57 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0213812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0682  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4058  protein of unknown function DUF1290  41.67 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0831  hypothetical protein  50.54 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00113741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1062  protein of unknown function DUF1290  39.81 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2066  protein of unknown function DUF1290  41.12 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00878211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1026  protein of unknown function DUF1290  42.31 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3504  hypothetical protein  36.79 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1429  hypothetical protein  49.43 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00327831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0782  hypothetical protein  36.54 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000814853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1896  protein of unknown function DUF1290  44.09 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2005  hypothetical protein  40.43 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0328457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0443  hypothetical protein  37.21 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0469833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>