42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1229 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1229  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  220  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1304  protein of unknown function DUF1290  71.82 
 
 
110 aa  163  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.959278  normal  0.758297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18240  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  72.73 
 
 
110 aa  163  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.596728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3099  protein of unknown function DUF1290  73.39 
 
 
110 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2104  protein of unknown function DUF1290  71.82 
 
 
110 aa  155  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1888  protein of unknown function DUF1290  68.18 
 
 
110 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.17032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4013  protein of unknown function DUF1290  73.58 
 
 
110 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0673159  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1736  protein of unknown function DUF1290  80.65 
 
 
110 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.530931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3125  protein of unknown function DUF1290  73.64 
 
 
110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2523  hypothetical protein  78.49 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15000  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  64.55 
 
 
110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0759178  normal  0.760857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2385  hypothetical protein  77.42 
 
 
110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2716  hypothetical protein  70.91 
 
 
110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15500  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  68.82 
 
 
110 aa  130  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2729  protein of unknown function DUF1290  77.17 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3405  hypothetical protein  68.87 
 
 
110 aa  123  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.349245  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11854  hypothetical protein  67.62 
 
 
121 aa  120  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.867075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2847  hypothetical protein  66.67 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2878  hypothetical protein  66.67 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2891  hypothetical protein  66.67 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0475  hypothetical protein  60.95 
 
 
110 aa  110  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0581165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3138  hypothetical protein  68.82 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360881  normal  0.0390517 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0800  small basic protein  54.72 
 
 
110 aa  105  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1465  hypothetical protein  51.38 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1286  protein of unknown function DUF1290  47.66 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.852068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0848  hypothetical protein  41.67 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00236162  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1556  protein of unknown function DUF1290  47.22 
 
 
115 aa  90.5  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5000  hypothetical protein  59.34 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0682  hypothetical protein  41.44 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4058  protein of unknown function DUF1290  38.89 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1429  hypothetical protein  47.13 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00327831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3504  hypothetical protein  33.96 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1062  protein of unknown function DUF1290  36.04 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2110  small basic protein  44.55 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.226594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1824  small basic protein  44.55 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0213812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0831  hypothetical protein  48.19 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00113741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0782  hypothetical protein  34.58 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000814853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1026  protein of unknown function DUF1290  36.54 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2066  protein of unknown function DUF1290  36.45 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00878211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1896  protein of unknown function DUF1290  38.71 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2005  hypothetical protein  37.23 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0328457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0443  hypothetical protein  34.09 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0469833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>