42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1896 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1896  protein of unknown function DUF1290  100 
 
 		 120 aa  237  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1026  protein of unknown function DUF1290  81.67 
 
 		 120 aa  199  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1286  protein of unknown function DUF1290  53.78 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.852068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4058  protein of unknown function DUF1290  60.58 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000257142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0848  hypothetical protein  54.81 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00236162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1062  protein of unknown function DUF1290  52.17 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3504  hypothetical protein  49.04 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1556  protein of unknown function DUF1290  52.21 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0682  hypothetical protein  51.33 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2066  protein of unknown function DUF1290  43.75 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00878211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0443  hypothetical protein  46.81 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0469833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0831  hypothetical protein  52.94 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00113741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1824  small basic protein  48.15 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0213812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2110  small basic protein  48.15 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.226594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1429  hypothetical protein  57.32 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00327831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2005  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0328457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2104  protein of unknown function DUF1290  46.3 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0782  hypothetical protein  35.83 
 
 		 120 aa  87.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000814853  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1888  protein of unknown function DUF1290  46.08 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.17032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15500  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  50.57 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.700555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18240  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  43.81 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.596728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3099  protein of unknown function DUF1290  45.19 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1304  protein of unknown function DUF1290  44.55 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.959278  normal  0.758297 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1229  hypothetical protein  38.46 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15000  uncharacterized conserved protein (small basic protein)  41.35 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0759178  normal  0.760857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4013  protein of unknown function DUF1290  41.18 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0673159  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1736  protein of unknown function DUF1290  45.88 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.530931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2385  hypothetical protein  42.35 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2523  hypothetical protein  42.35 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2716  hypothetical protein  42.57 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0475  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0581165  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0800  small basic protein  40.2 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3405  hypothetical protein  40.2 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.349245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3125  protein of unknown function DUF1290  40.59 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2878  hypothetical protein  41.41 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2891  hypothetical protein  41.41 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2847  hypothetical protein  41.41 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11854  hypothetical protein  40.4 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2729  protein of unknown function DUF1290  45.88 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3138  hypothetical protein  41.86 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360881  normal  0.0390517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1465  hypothetical protein  35.29 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5000  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>