109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3126 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3126  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  338  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0448941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0778  protein of unknown function DUF151  51.5 
 
 
167 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0762  protein of unknown function DUF151  49.7 
 
 
167 aa  177  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2295  hypothetical protein  43.98 
 
 
166 aa  148  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2197  hypothetical protein  46.99 
 
 
166 aa  147  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0418  hypothetical protein  28.14 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1590  protein of unknown function DUF151  33.12 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241237  normal  0.830999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1331  protein of unknown function DUF151  29.89 
 
 
242 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1875  hypothetical protein  29.52 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.653331  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0242  protein of unknown function DUF151  33.76 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0495008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4387  protein of unknown function DUF151  30.97 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2354  hypothetical protein  27.06 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128837  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1274  protein of unknown function DUF151  29.92 
 
 
204 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.907668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0583  protein of unknown function DUF151  30.57 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331975  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0821  protein of unknown function DUF151  30.3 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.501387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1071  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208714  hitchhiker  0.00414947 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2763  hypothetical protein  33.12 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1415  hypothetical protein  32.48 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1219  protein of unknown function DUF151  30.77 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1249  protein of unknown function DUF151  30.77 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2379  hypothetical protein  28.36 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2568  hypothetical protein  28.85 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.334798  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1844  protein of unknown function DUF151  30.32 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22570  hypothetical protein  25.79 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309185  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06361  hypothetical protein  26.26 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5354  protein of unknown function DUF151  26.42 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2773  protein of unknown function DUF151  25.77 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.303456  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1396  hypothetical protein  26.35 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4004  protein of unknown function DUF151  26.38 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688832  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3133  hypothetical protein  26.25 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0655971 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0037  protein of unknown function DUF151  23.17 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.210982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1471  protein of unknown function DUF151  26.35 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11859  hypothetical protein  26.95 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.543843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2432  protein of unknown function DUF151  25 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2724  protein of unknown function DUF151  25 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0848  protein of unknown function DUF151  28.14 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0513617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0919  protein of unknown function DUF151  29.13 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0603  hypothetical protein  27.84 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2005  hypothetical protein  26.09 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  0.331103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3400  hypothetical protein  25.62 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765241  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5941  protein of unknown function DUF151  22.44 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2842  hypothetical protein  26.25 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1224  hypothetical protein  24.85 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.414379  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2886  hypothetical protein  26.25 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2873  hypothetical protein  26.25 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_495  hypothetical protein  25.61 
 
 
189 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000100237  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1759  hypothetical protein  26.7 
 
 
190 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2711  hypothetical protein  24.69 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1695  hypothetical protein  24.39 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0261327  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3741  hypothetical protein  26.25 
 
 
154 aa  60.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4995  hypothetical protein  26.25 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1470  hypothetical protein  27.22 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0530  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000860812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0128  hypothetical protein  26.47 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1111  hypothetical protein  25.33 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000542394  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2460  hypothetical protein  26.72 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1780  hypothetical protein  28.67 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2337  protein of unknown function DUF151  25.37 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0187  hypothetical protein  26.85 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.780636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4008  protein of unknown function DUF151  25.58 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.680842  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0858  protein of unknown function DUF151  26.09 
 
 
150 aa  55.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0836  hypothetical protein  30.16 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2518  hypothetical protein  23.75 
 
 
167 aa  54.7  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000889527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2380  hypothetical protein  23.12 
 
 
173 aa  53.9  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113259  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3094  protein of unknown function DUF151  23.75 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.094995  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0929  hypothetical protein  23.6 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0868  protein of unknown function DUF151  21.31 
 
 
191 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000608539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1544  protein of unknown function DUF151  25.2 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00135438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2435  protein of unknown function DUF151  28.33 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1543  hypothetical protein  25.98 
 
 
167 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0003  protein of unknown function DUF151  28.33 
 
 
238 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.694021 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2071  hypothetical protein  25.42 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0573597  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0021  protein of unknown function DUF151  29.73 
 
 
216 aa  50.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0777  hypothetical protein  29.27 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0261295  hitchhiker  0.00887268 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0036  hypothetical protein  26.61 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0308  protein of unknown function DUF151  26.42 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2219  protein of unknown function DUF151  26.92 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000646994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3130  protein of unknown function DUF151  24.69 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0668  protein of unknown function DUF151  29.2 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2136  protein of unknown function DUF151  26.05 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450103 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1128  protein of unknown function DUF151  26.42 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0711  protein of unknown function DUF151  23.64 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13288  hypothetical protein  27.03 
 
 
206 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1884  protein of unknown function DUF151  33.33 
 
 
168 aa  47.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0632621 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1566  protein of unknown function DUF151  27.12 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0928  hypothetical protein  24.56 
 
 
161 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.596114  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3546  protein of unknown function DUF151  28.81 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1472  hypothetical protein  25.45 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0765  hypothetical protein  27.54 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0788  hypothetical protein  27.54 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0856  hypothetical protein  27.93 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.323862  normal  0.663691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0397  protein of unknown function DUF151  27.5 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00160874  hitchhiker  0.0000295768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1242  protein of unknown function DUF151  23.64 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1740  protein of unknown function DUF151  27.56 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.2629  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1176  hypothetical protein  27.05 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0354  hypothetical protein  25.21 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1361  hypothetical protein  25.66 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183231  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0115  hypothetical protein  25.21 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0328  protein of unknown function DUF151  28.95 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000184753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2100  protein of unknown function DUF151  26.32 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>