130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5354 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5354  protein of unknown function DUF151  100 
 
 
157 aa  308  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22570  hypothetical protein  89.81 
 
 
157 aa  282  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309185  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2842  hypothetical protein  71.78 
 
 
164 aa  239  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2886  hypothetical protein  71.78 
 
 
164 aa  239  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2873  hypothetical protein  71.78 
 
 
164 aa  239  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3400  hypothetical protein  70.12 
 
 
164 aa  234  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765241  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3133  hypothetical protein  70.12 
 
 
164 aa  234  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0655971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11859  hypothetical protein  68.9 
 
 
164 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.543843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1396  hypothetical protein  69.74 
 
 
156 aa  223  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2380  hypothetical protein  70.13 
 
 
173 aa  220  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2432  protein of unknown function DUF151  70.39 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2724  protein of unknown function DUF151  71.71 
 
 
163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2518  hypothetical protein  68.83 
 
 
167 aa  216  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000889527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2773  protein of unknown function DUF151  63.41 
 
 
167 aa  216  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.303456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1471  protein of unknown function DUF151  67.76 
 
 
157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3741  hypothetical protein  65.13 
 
 
154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2711  hypothetical protein  68 
 
 
159 aa  205  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3094  protein of unknown function DUF151  65.79 
 
 
159 aa  205  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.094995  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4004  protein of unknown function DUF151  65.77 
 
 
153 aa  200  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688832  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4008  protein of unknown function DUF151  61.08 
 
 
171 aa  199  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.680842  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1695  hypothetical protein  63.16 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0261327  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1224  hypothetical protein  64.33 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.414379  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3130  protein of unknown function DUF151  64.94 
 
 
156 aa  191  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4995  hypothetical protein  61.78 
 
 
161 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1470  hypothetical protein  61.15 
 
 
161 aa  187  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2337  protein of unknown function DUF151  59.88 
 
 
172 aa  177  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1543  hypothetical protein  47.9 
 
 
167 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1544  protein of unknown function DUF151  47.31 
 
 
167 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00135438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2100  protein of unknown function DUF151  49.06 
 
 
173 aa  133  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5941  protein of unknown function DUF151  41.1 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_495  hypothetical protein  38.04 
 
 
189 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000100237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1740  protein of unknown function DUF151  52 
 
 
184 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.2629  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0530  hypothetical protein  38.04 
 
 
189 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000860812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0848  protein of unknown function DUF151  40.76 
 
 
157 aa  121  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0513617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0354  hypothetical protein  40.85 
 
 
193 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0115  hypothetical protein  44.12 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4387  protein of unknown function DUF151  45.91 
 
 
169 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1128  protein of unknown function DUF151  46.01 
 
 
168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1331  protein of unknown function DUF151  50.39 
 
 
242 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2354  hypothetical protein  35.98 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2136  protein of unknown function DUF151  45.65 
 
 
191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0418  hypothetical protein  37.89 
 
 
165 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1415  hypothetical protein  42.41 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1111  hypothetical protein  43.07 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000542394  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13830  hypothetical protein  44.81 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0242  protein of unknown function DUF151  41.77 
 
 
167 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0495008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4358  hypothetical protein  37.14 
 
 
178 aa  110  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.305208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1590  protein of unknown function DUF151  39.16 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241237  normal  0.830999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1219  protein of unknown function DUF151  41.77 
 
 
170 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1249  protein of unknown function DUF151  41.77 
 
 
170 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2763  hypothetical protein  39.87 
 
 
165 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2379  hypothetical protein  45.53 
 
 
183 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1274  protein of unknown function DUF151  41.83 
 
 
204 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.907668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0821  protein of unknown function DUF151  37.82 
 
 
160 aa  107  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.501387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1071  hypothetical protein  41.94 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208714  hitchhiker  0.00414947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2568  hypothetical protein  39.49 
 
 
168 aa  107  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.334798  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0583  protein of unknown function DUF151  37.27 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1844  protein of unknown function DUF151  51.82 
 
 
153 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1753  hypothetical protein  44.26 
 
 
201 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0351861  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2460  hypothetical protein  40.12 
 
 
166 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1875  hypothetical protein  34.64 
 
 
161 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.653331  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1884  protein of unknown function DUF151  41.83 
 
 
168 aa  101  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0632621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1361  hypothetical protein  45.13 
 
 
210 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183231  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0868  protein of unknown function DUF151  32.98 
 
 
191 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000608539  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0431  protein of unknown function DUF151  40.3 
 
 
198 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000235563  normal  0.0443152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0668  protein of unknown function DUF151  48.72 
 
 
197 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0010  protein of unknown function DUF151  38.1 
 
 
169 aa  98.6  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315658 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1050  hypothetical protein  39.26 
 
 
201 aa  97.8  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.931786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0397  protein of unknown function DUF151  44.92 
 
 
200 aa  97.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00160874  hitchhiker  0.0000295768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0919  protein of unknown function DUF151  36.96 
 
 
180 aa  97.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3758  protein of unknown function DUF151  42.61 
 
 
200 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16268  hitchhiker  0.00121907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1242  protein of unknown function DUF151  41.96 
 
 
197 aa  97.1  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0008  protein of unknown function DUF151  43.51 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.756482  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2005  hypothetical protein  51.16 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  0.331103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0711  protein of unknown function DUF151  45.05 
 
 
198 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0037  protein of unknown function DUF151  30.63 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.210982  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0603  hypothetical protein  36.59 
 
 
182 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0328  protein of unknown function DUF151  40.54 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000184753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0395  hypothetical protein  40.54 
 
 
219 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000988242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2212  hypothetical protein  44.92 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000965632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0431  protein of unknown function DUF151  40.54 
 
 
197 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.741261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0836  hypothetical protein  41.61 
 
 
158 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0462  hypothetical protein  42.34 
 
 
202 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.086109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2055  protein of unknown function DUF151  40.3 
 
 
203 aa  90.5  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0271607 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0128  hypothetical protein  30.72 
 
 
175 aa  89  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1640  hypothetical protein  43.2 
 
 
293 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.398203  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1759  hypothetical protein  34.76 
 
 
190 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1192  protein of unknown function DUF151  35.77 
 
 
202 aa  85.9  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1472  hypothetical protein  39.57 
 
 
207 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0187  hypothetical protein  30.57 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.780636  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0929  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13288  hypothetical protein  35.97 
 
 
206 aa  84  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2219  protein of unknown function DUF151  36.15 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000646994  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06361  hypothetical protein  34.55 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0313  protein of unknown function DUF151  40.59 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0308  protein of unknown function DUF151  33.33 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0693  hypothetical protein  33.85 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2350  protein of unknown function DUF151  41.88 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2071  hypothetical protein  37.5 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0573597  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1515  hypothetical protein  39.81 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>