131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0328 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0328  protein of unknown function DUF151  100 
 
 
200 aa  400  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000184753  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1753  hypothetical protein  75.88 
 
 
201 aa  299  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0351861  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0431  protein of unknown function DUF151  79.7 
 
 
197 aa  294  5e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.741261  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0431  protein of unknown function DUF151  74.75 
 
 
198 aa  291  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000235563  normal  0.0443152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0395  hypothetical protein  74.02 
 
 
219 aa  289  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000988242  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0462  hypothetical protein  69.46 
 
 
202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.086109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0397  protein of unknown function DUF151  72.86 
 
 
200 aa  278  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00160874  hitchhiker  0.0000295768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0668  protein of unknown function DUF151  55.33 
 
 
197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2055  protein of unknown function DUF151  46.73 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0271607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1472  hypothetical protein  46.6 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13288  hypothetical protein  46.57 
 
 
206 aa  168  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1361  hypothetical protein  43.27 
 
 
210 aa  165  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183231  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0711  protein of unknown function DUF151  47 
 
 
198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1242  protein of unknown function DUF151  46.67 
 
 
197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3758  protein of unknown function DUF151  41.21 
 
 
200 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16268  hitchhiker  0.00121907 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1192  protein of unknown function DUF151  42.64 
 
 
202 aa  151  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3873  protein of unknown function DUF151  41.12 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1050  hypothetical protein  39.6 
 
 
201 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.931786 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0530  hypothetical protein  45.26 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000860812  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_495  hypothetical protein  43.8 
 
 
189 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000100237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0354  hypothetical protein  44.44 
 
 
193 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0115  hypothetical protein  41.13 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0848  protein of unknown function DUF151  43.88 
 
 
157 aa  118  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0513617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0021  protein of unknown function DUF151  36.32 
 
 
216 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4358  hypothetical protein  38.71 
 
 
178 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.305208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1415  hypothetical protein  39.16 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1224  hypothetical protein  40.28 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.414379  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2136  protein of unknown function DUF151  42.75 
 
 
191 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1219  protein of unknown function DUF151  40.67 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1249  protein of unknown function DUF151  40.67 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0418  hypothetical protein  38.51 
 
 
165 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1111  hypothetical protein  39.69 
 
 
160 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000542394  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2763  hypothetical protein  40.32 
 
 
165 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0821  protein of unknown function DUF151  39.22 
 
 
160 aa  104  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.501387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0242  protein of unknown function DUF151  38.36 
 
 
167 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0495008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2568  hypothetical protein  36.31 
 
 
168 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.334798  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2460  hypothetical protein  41.94 
 
 
166 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1471  protein of unknown function DUF151  43.44 
 
 
157 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4008  protein of unknown function DUF151  43.09 
 
 
171 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.680842  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0693  hypothetical protein  39.86 
 
 
143 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2219  protein of unknown function DUF151  43.1 
 
 
133 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000646994  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2711  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1875  hypothetical protein  39.2 
 
 
161 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.653331  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1396  hypothetical protein  42.62 
 
 
156 aa  101  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2044  protein of unknown function DUF151  39.57 
 
 
146 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248779  hitchhiker  0.00000000029201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1071  hypothetical protein  40.32 
 
 
188 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208714  hitchhiker  0.00414947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2337  protein of unknown function DUF151  42.64 
 
 
172 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2354  hypothetical protein  43.55 
 
 
167 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1331  protein of unknown function DUF151  35.03 
 
 
242 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2773  protein of unknown function DUF151  39.58 
 
 
167 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.303456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3130  protein of unknown function DUF151  38.76 
 
 
156 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22570  hypothetical protein  38.52 
 
 
157 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309185  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2432  protein of unknown function DUF151  36.6 
 
 
156 aa  98.6  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1844  protein of unknown function DUF151  42.74 
 
 
153 aa  98.6  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2724  protein of unknown function DUF151  39.26 
 
 
163 aa  98.2  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1590  protein of unknown function DUF151  35.33 
 
 
164 aa  98.2  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241237  normal  0.830999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4387  protein of unknown function DUF151  40.32 
 
 
169 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2212  hypothetical protein  41.9 
 
 
140 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000965632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3741  hypothetical protein  35.95 
 
 
154 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3133  hypothetical protein  39.53 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0655971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3400  hypothetical protein  39.86 
 
 
164 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765241  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2379  hypothetical protein  35.04 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5354  protein of unknown function DUF151  38.52 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1128  protein of unknown function DUF151  38.76 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2518  hypothetical protein  37.96 
 
 
167 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000889527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11859  hypothetical protein  42.15 
 
 
164 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.543843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1695  hypothetical protein  37.41 
 
 
156 aa  95.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0261327  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4004  protein of unknown function DUF151  39.26 
 
 
153 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688832  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5941  protein of unknown function DUF151  40.54 
 
 
163 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2380  hypothetical protein  37.23 
 
 
173 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113259  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0836  hypothetical protein  42.28 
 
 
158 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1544  protein of unknown function DUF151  36.62 
 
 
167 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00135438 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0919  protein of unknown function DUF151  39.66 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1543  hypothetical protein  35.92 
 
 
167 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1274  protein of unknown function DUF151  34.48 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.907668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2842  hypothetical protein  38.85 
 
 
164 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2886  hypothetical protein  38.85 
 
 
164 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2873  hypothetical protein  38.85 
 
 
164 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0308  protein of unknown function DUF151  41.44 
 
 
235 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274422 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1975  hypothetical protein  44.34 
 
 
153 aa  92  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2350  protein of unknown function DUF151  34.93 
 
 
142 aa  91.7  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0037  protein of unknown function DUF151  32.28 
 
 
164 aa  91.7  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.210982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4995  hypothetical protein  41.07 
 
 
161 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1470  hypothetical protein  41.07 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3094  protein of unknown function DUF151  34.48 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.094995  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2071  hypothetical protein  41.35 
 
 
149 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0573597  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0313  protein of unknown function DUF151  40.18 
 
 
138 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0856  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  88.2  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.323862  normal  0.663691 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0777  hypothetical protein  42.42 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0261295  hitchhiker  0.00887268 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1176  hypothetical protein  42.42 
 
 
153 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0868  protein of unknown function DUF151  37.72 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000608539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0858  protein of unknown function DUF151  36.36 
 
 
150 aa  84.7  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0107  hypothetical protein  41.79 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.787303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1780  hypothetical protein  33.07 
 
 
148 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1515  hypothetical protein  34.15 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0928  hypothetical protein  34.35 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.596114  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0719  electron transport complex, RnfABCDGE type, A subunit  36.51 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0600107  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0765  hypothetical protein  36.91 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0788  hypothetical protein  36.91 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>