84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0762 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0762  protein of unknown function DUF151  100 
 
 		 167 aa  340  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0778  protein of unknown function DUF151  95.81 
 
 		 167 aa  328  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3126  hypothetical protein  49.7 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0448941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2295  hypothetical protein  43.71 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2197  hypothetical protein  43.27 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1071  hypothetical protein  31.1 
 
 		 188 aa  84.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208714  hitchhiker  0.00414947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1590  protein of unknown function DUF151  32.14 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241237  normal  0.830999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0583  protein of unknown function DUF151  33.33 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4387  protein of unknown function DUF151  30.38 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0821  protein of unknown function DUF151  29.01 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.501387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0242  protein of unknown function DUF151  30.86 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0495008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5941  protein of unknown function DUF151  24.36 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1219  protein of unknown function DUF151  30.86 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1249  protein of unknown function DUF151  30.86 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1415  hypothetical protein  28.22 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2763  hypothetical protein  28.22 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1274  protein of unknown function DUF151  27.69 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.907668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2568  hypothetical protein  28.22 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.334798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2354  hypothetical protein  25.29 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1396  hypothetical protein  26.54 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1875  hypothetical protein  24.55 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.653331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0418  hypothetical protein  20.96 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0037  protein of unknown function DUF151  21.57 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.210982  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0603  hypothetical protein  24.86 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2773  protein of unknown function DUF151  22.98 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.303456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0128  hypothetical protein  23.08 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1759  hypothetical protein  24.28 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1471  protein of unknown function DUF151  25.62 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5354  protein of unknown function DUF151  29.56 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1331  protein of unknown function DUF151  25.81 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3133  hypothetical protein  23.6 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0655971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2432  protein of unknown function DUF151  27.88 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3400  hypothetical protein  23.6 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765241  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2380  hypothetical protein  23.72 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06361  hypothetical protein  23.43 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22570  hypothetical protein  24.36 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2886  hypothetical protein  24.22 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2873  hypothetical protein  24.22 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2842  hypothetical protein  24.22 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0530  hypothetical protein  25.15 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000860812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2379  hypothetical protein  24.81 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0719  electron transport complex, RnfABCDGE type, A subunit  28.07 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0600107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2724  protein of unknown function DUF151  23.72 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1470  hypothetical protein  23.57 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1128  protein of unknown function DUF151  25.47 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4004  protein of unknown function DUF151  24.84 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688832  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3741  hypothetical protein  24.36 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2136  protein of unknown function DUF151  25.83 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000450103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11859  hypothetical protein  23.6 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.543843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2518  hypothetical protein  21.79 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000889527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1111  hypothetical protein  22.5 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000542394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_495  hypothetical protein  23.31 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000100237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0354  hypothetical protein  24.65 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4995  hypothetical protein  22.93 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0836  hypothetical protein  24.8 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0848  protein of unknown function DUF151  24.43 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0513617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0115  hypothetical protein  25.19 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2044  protein of unknown function DUF151  21.23 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248779  hitchhiker  0.00000000029201 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0929  hypothetical protein  23.6 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2337  protein of unknown function DUF151  23.08 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2711  hypothetical protein  24.24 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2005  hypothetical protein  24.62 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  0.331103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0919  protein of unknown function DUF151  21.09 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13288  hypothetical protein  25.93 
 
 		 206 aa  47.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65137  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0187  hypothetical protein  20.83 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.780636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1695  hypothetical protein  23.93 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0261327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2460  hypothetical protein  21.05 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1844  protein of unknown function DUF151  27.64 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3094  protein of unknown function DUF151  23.57 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.094995  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2100  protein of unknown function DUF151  24.26 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0928  hypothetical protein  22.5 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.596114  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2219  protein of unknown function DUF151  24.63 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000646994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2118  protein of unknown function DUF151  23.62 
 
 		 288 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1192  protein of unknown function DUF151  22.94 
 
 		 202 aa  44.7  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4008  protein of unknown function DUF151  20.59 
 
 		 171 aa  44.3  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.680842  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3873  protein of unknown function DUF151  25.93 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0868  protein of unknown function DUF151  21.48 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000608539  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1472  hypothetical protein  21.68 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0308  protein of unknown function DUF151  25.81 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4358  hypothetical protein  22.94 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.305208  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1224  hypothetical protein  22.7 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.414379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0668  protein of unknown function DUF151  24.22 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0856  hypothetical protein  22.81 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.323862  normal  0.663691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5868  protein of unknown function DUF151  25.81 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.586811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>