136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0115 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0115  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0354  hypothetical protein  89.12 
 
 		 193 aa  352  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2136  protein of unknown function DUF151  60.42 
 
 		 191 aa  227  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000450103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4358  hypothetical protein  54.3 
 
 		 178 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.305208  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_495  hypothetical protein  46.6 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000100237  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0530  hypothetical protein  45.79 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000860812  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0919  protein of unknown function DUF151  39.15 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0848  protein of unknown function DUF151  43.36 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0513617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22570  hypothetical protein  44.85 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11859  hypothetical protein  45.89 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.543843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2460  hypothetical protein  45.38 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1111  hypothetical protein  49.09 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000542394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2842  hypothetical protein  43.62 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2886  hypothetical protein  43.62 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2873  hypothetical protein  43.62 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3400  hypothetical protein  45.89 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765241  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3133  hypothetical protein  38.04 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0655971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5354  protein of unknown function DUF151  44.12 
 
 		 157 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1396  hypothetical protein  41.91 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1224  hypothetical protein  44.93 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.414379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4995  hypothetical protein  45.38 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2773  protein of unknown function DUF151  35.79 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.303456  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1470  hypothetical protein  45.38 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0668  protein of unknown function DUF151  49.57 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0328  protein of unknown function DUF151  46.85 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000184753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2337  protein of unknown function DUF151  42.65 
 
 		 172 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2518  hypothetical protein  42.86 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000889527 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0462  hypothetical protein  45.93 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.086109  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2568  hypothetical protein  40.27 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.334798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1471  protein of unknown function DUF151  41.91 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0010  protein of unknown function DUF151  44.44 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2380  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0397  protein of unknown function DUF151  46.43 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00160874  hitchhiker  0.0000295768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4008  protein of unknown function DUF151  35.33 
 
 		 171 aa  114  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.680842  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2711  hypothetical protein  43.8 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2212  hypothetical protein  44.26 
 
 		 140 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000965632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0431  protein of unknown function DUF151  35.15 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000235563  normal  0.0443152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2432  protein of unknown function DUF151  44.53 
 
 		 156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3758  protein of unknown function DUF151  39.39 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16268  hitchhiker  0.00121907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3741  hypothetical protein  42.66 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1695  hypothetical protein  43.26 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0261327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4387  protein of unknown function DUF151  41.61 
 
 		 169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1875  hypothetical protein  44.35 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.653331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0021  protein of unknown function DUF151  36.84 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0128  hypothetical protein  32.34 
 
 		 175 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0395  hypothetical protein  46.85 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000988242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1415  hypothetical protein  38.73 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2044  protein of unknown function DUF151  43.31 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248779  hitchhiker  0.00000000029201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1219  protein of unknown function DUF151  38.93 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1249  protein of unknown function DUF151  38.93 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547101 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1128  protein of unknown function DUF151  36.22 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1844  protein of unknown function DUF151  44.53 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0431  protein of unknown function DUF151  41.27 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.741261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3130  protein of unknown function DUF151  43.65 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2763  hypothetical protein  38.93 
 
 		 165 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3094  protein of unknown function DUF151  43.51 
 
 		 159 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.094995  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0037  protein of unknown function DUF151  39.85 
 
 		 164 aa  108  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.210982  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1361  hypothetical protein  45.61 
 
 		 210 aa  107  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0836  hypothetical protein  41.3 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1753  hypothetical protein  45.05 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0351861  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5941  protein of unknown function DUF151  37.88 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0308  protein of unknown function DUF151  35 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0242  protein of unknown function DUF151  37.91 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0495008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2724  protein of unknown function DUF151  42.34 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4004  protein of unknown function DUF151  41.98 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688832  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0868  protein of unknown function DUF151  34.55 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000608539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1543  hypothetical protein  42.65 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1071  hypothetical protein  38.03 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208714  hitchhiker  0.00414947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1242  protein of unknown function DUF151  45.54 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1590  protein of unknown function DUF151  39.06 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241237  normal  0.830999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1544  protein of unknown function DUF151  41.79 
 
 		 167 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00135438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2219  protein of unknown function DUF151  42.97 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000646994  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1274  protein of unknown function DUF151  39.53 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.907668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0711  protein of unknown function DUF151  45.05 
 
 		 198 aa  101  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1331  protein of unknown function DUF151  42.31 
 
 		 242 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101636 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0928  hypothetical protein  45.05 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.596114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2055  protein of unknown function DUF151  43.86 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0271607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2354  hypothetical protein  42.2 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0821  protein of unknown function DUF151  35.38 
 
 		 160 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.501387  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1050  hypothetical protein  38.98 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.931786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2379  hypothetical protein  35.66 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0418  hypothetical protein  38.28 
 
 		 165 aa  99  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13288  hypothetical protein  35.62 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2350  protein of unknown function DUF151  41.54 
 
 		 142 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0765  hypothetical protein  39.73 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0788  hypothetical protein  39.73 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0693  hypothetical protein  36.15 
 
 		 143 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0929  hypothetical protein  34.04 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0313  protein of unknown function DUF151  42.59 
 
 		 138 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1472  hypothetical protein  34.81 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0008  protein of unknown function DUF151  45.69 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.756482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3874  hypothetical protein  42.42 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal  0.0361248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2100  protein of unknown function DUF151  40.58 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0719  electron transport complex, RnfABCDGE type, A subunit  46.43 
 
 		 360 aa  89.4  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0600107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1515  hypothetical protein  37.01 
 
 		 154 aa  89  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3873  protein of unknown function DUF151  36.75 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1192  protein of unknown function DUF151  33.79 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0187  hypothetical protein  30.53 
 
 		 172 aa  86.3  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.780636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0003  protein of unknown function DUF151  39.13 
 
 		 238 aa  85.1  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.694021 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2435  protein of unknown function DUF151  36.62 
 
 		 177 aa  85.1  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>