75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2295 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2295  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  329  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167391  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2197  hypothetical protein  62.65 
 
 
166 aa  205  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0778  protein of unknown function DUF151  43.71 
 
 
167 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0762  protein of unknown function DUF151  43.71 
 
 
167 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3126  hypothetical protein  43.98 
 
 
166 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0448941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1875  hypothetical protein  30.72 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.653331  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0418  hypothetical protein  25.3 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1590  protein of unknown function DUF151  30.12 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241237  normal  0.830999 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1071  hypothetical protein  28.83 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208714  hitchhiker  0.00414947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5941  protein of unknown function DUF151  27.04 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1249  protein of unknown function DUF151  29.38 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0821  protein of unknown function DUF151  28.83 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.501387  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1219  protein of unknown function DUF151  29.38 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2354  hypothetical protein  25.9 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0530  hypothetical protein  27.42 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000860812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4387  protein of unknown function DUF151  26.42 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2568  hypothetical protein  29.63 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.334798  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0242  protein of unknown function DUF151  26.42 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0495008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1396  hypothetical protein  28.93 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_495  hypothetical protein  26.88 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000100237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2763  hypothetical protein  25.47 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0128  hypothetical protein  25.73 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1415  hypothetical protein  26.71 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22570  hypothetical protein  27.22 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309185  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1274  protein of unknown function DUF151  24.29 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.907668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3741  hypothetical protein  28.12 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4995  hypothetical protein  25.95 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2460  hypothetical protein  23.85 
 
 
166 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0583  protein of unknown function DUF151  28.92 
 
 
164 aa  57.4  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1331  protein of unknown function DUF151  26.92 
 
 
242 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2724  protein of unknown function DUF151  25.32 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0115  hypothetical protein  26.19 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2136  protein of unknown function DUF151  30.43 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1471  protein of unknown function DUF151  27.04 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2518  hypothetical protein  26.71 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000889527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4358  hypothetical protein  24.82 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.305208  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1470  hypothetical protein  25.32 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2380  hypothetical protein  26.09 
 
 
173 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113259  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0354  hypothetical protein  24.6 
 
 
193 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2379  hypothetical protein  22.7 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0836  hypothetical protein  24.84 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0848  protein of unknown function DUF151  25 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0513617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0919  protein of unknown function DUF151  25.2 
 
 
180 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2044  protein of unknown function DUF151  24.6 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248779  hitchhiker  0.00000000029201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2005  hypothetical protein  24.59 
 
 
181 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  0.331103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5354  protein of unknown function DUF151  24.05 
 
 
157 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2711  hypothetical protein  24.54 
 
 
159 aa  50.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403135  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0603  hypothetical protein  24.28 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4008  protein of unknown function DUF151  24.42 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.680842  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2432  protein of unknown function DUF151  25 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2773  protein of unknown function DUF151  23.03 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.303456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1844  protein of unknown function DUF151  27.66 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1695  hypothetical protein  24.84 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0261327  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1128  protein of unknown function DUF151  27.22 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0037  protein of unknown function DUF151  25.47 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.210982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2219  protein of unknown function DUF151  27.07 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000646994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11859  hypothetical protein  24.54 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.543843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0187  hypothetical protein  23.72 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.780636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1111  hypothetical protein  22.78 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000542394  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0929  hypothetical protein  25.29 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1759  hypothetical protein  31.03 
 
 
190 aa  48.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06361  hypothetical protein  24 
 
 
194 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0868  protein of unknown function DUF151  21.47 
 
 
191 aa  47.4  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000608539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0010  protein of unknown function DUF151  25.83 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3094  protein of unknown function DUF151  24.2 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.094995  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4004  protein of unknown function DUF151  23.9 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688832  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1224  hypothetical protein  24.38 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.414379  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2886  hypothetical protein  23.31 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2873  hypothetical protein  23.31 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2842  hypothetical protein  23.31 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3400  hypothetical protein  20.86 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765241  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3133  hypothetical protein  22.09 
 
 
164 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0655971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2337  protein of unknown function DUF151  22.83 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3758  protein of unknown function DUF151  23.15 
 
 
200 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16268  hitchhiker  0.00121907 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0928  hypothetical protein  24.79 
 
 
161 aa  42  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.596114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>