25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4644 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  427  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  34.95 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  33.5 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  35.07 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  33.48 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4353  hypothetical protein  34.74 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  30.87 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  27.31 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3946  hypothetical protein  39.53 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.125264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0339  hypothetical protein  31.98 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  28.39 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0295  hypothetical protein  30.63 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4985  hypothetical protein  36.46 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  32.08 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  29.67 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  34.96 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  31.51 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  34.72 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  35.51 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  34.25 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  29.18 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0849  hypothetical protein  31.15 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5098  hypothetical protein  45.61 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 583 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1649  hypothetical protein  37.66 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>